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【求助/交流】酿酒酵母URA3基因敲除的问题
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xtcao668
至尊木虫
(著名写手)
应助: 10
(幼儿园)
金币: 20473.8
帖子: 1109
在线: 61.1小时
虫号: 481086
[交流]
【求助/交流】酿酒酵母URA3基因敲除的问题
个人目前做酿酒酵母过表达的研究,由于所用质粒上的筛选标记是URA3(尿嘧啶)营养缺陷,而目标菌株是工业二倍体酵母。所以就根据文献利用5-FOA (5-氟乳清酸)通过PCR产物(两端带有URA3同源片段,中间为G418筛选标记的PCR产物)方法直接转化工业二倍体酵母, 一开始5-FOA浓度为0.2mg/ml 和2mg/ml 结果高浓度的平板不长,低浓度5-FOA的平板长满; 后来用利用YPD加G418筛选,结果利用SD/SD-URA培养基验证时发现都能生长;
接下来先测定了二倍体酵母5-FOA的抗性,发现0.5mg/ml ,1mg/ml 不能生长, 现在利用SD-URA-5-FOA-G418 平板来筛选,结果在1mg/ml 5-FOA G418浓度为120ug/ml 平板上长出菌落,但是再次利用SD/SD-URA 培养基验证时发现又全部能够生长,正常情况应该是SD不生长,只有补加URA3的SD才能生长。 请问各位虫友我的问题出在哪里?是不是应该将酵母单倍体话后再转化啊?
比较啰嗦 见谅! 谢谢帮忙
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1楼
2011-01-13 09:13:08
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冰艺于欣然
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2楼
:
Originally posted by
susizheng
at 2011-01-13 09:41:17
1、竟然是二倍体,你敲除的时候可能只是敲除了一半,因此一开始用SD/SD-URA筛选肯定的不容易得到预期结果,应该一开始用高浓度抗生素筛选,通过抗生素筛选后,再用SD/SD-URA筛选,如果通过抗生素筛选后不能通过SD/S ...
我要用酿酒酵母做基因的过表达,老师说我们现在的菌株是工业菌株,是二倍体,不太好做,我最近在网上查菌株呢。ATCC 204508是很多突变株的亲代菌株,那是不是是二倍体啊?还有很多文献用到Saccharomyces cerevisiae CEN.PK113-7D,可是我在网上都查不到哪儿有卖的。。。您知道什么单倍体菌株比较适合做过表达的么?我刚接课题,很菜鸟,请见谅啊。。。
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18楼
2013-11-08 10:20:49
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susizheng
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rainwander(金币+2):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-13 10:09:58
xtcao668(金币+1): 2011-01-13 10:18:20
1、竟然是二倍体,你敲除的时候可能只是敲除了一半,因此一开始用SD/SD-URA筛选肯定的不容易得到预期结果,应该一开始用高浓度抗生素筛选,通过抗生素筛选后,再用SD/SD-URA筛选,如果通过抗生素筛选后不能通过SD/SD-URA,说明只敲除了一半,要重新设计引物二次敲除。
2、最好不要选取工业二倍体酵母作为实验酵母,分子操作上会很麻烦,最好选用试验用的单倍体酵母。
3、酿酒酵母dropout类型现在又很多了,搞到一个URA3缺陷型的菌株也不难,何必自己敲除,费时又费力。
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2楼
2011-01-13 09:41:17
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gongeleven
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参考invitrogen的EBY100和pYD1质粒
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3楼
2011-01-13 12:58:16
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yatou996512
新虫
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖
请问一下,我也是要做URA3的筛选,你配培养基的时候,尿嘧啶和5-FOA高压灭菌了吗?如果没有,这两种药品,你是怎么配制的,按理化性质来说,特别不好溶解,谢谢
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5楼
2011-10-10 16:58:49
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