| 查看: 8561 | 回复: 7 | |||
[交流]
【求助】LAMMPS运行错误：Out of range atoms - cannot compute PPPM
|
|||
|
运行LAMMPS出现以下内容： LAMMPS (23 Aug 2010) > Scanning data file ... > 4 = max bonds/atom > 6 = max angles/atom > Reading data file ... > orthogonal box = (-3.3562 -3.181 -3.2099) to (26.4202 26.9708 26.1994) > 1 by 1 by 1 processor grid > 1388 atoms > 960 bonds > 688 angles > Finding 1-2 1-3 1-4 neighbors ... > 4 = max # of 1-2 neighbors > 3 = max # of 1-3 neighbors > 3 = max # of 1-4 neighbors > 4 = max # of special neighbors > 1388 atoms in group all > 1128 atoms in group water > 260 atoms in group methane > Finding SHAKE clusters ... > 0 = # of size 2 clusters > 0 = # of size 3 clusters > 0 = # of size 4 clusters > 376 = # of frozen angles > PPPM initialization ... > G vector = 0.30131 > grid = 25 25 24 > stencil order = 5 > RMS precision = 7.38705e-06 > brick FFT buffer size/proc = 38148 15000 17340 > Setting up run ... > Memory usage per processor = 14.4062 Mbytes > Step Temp Press Volume TotEng > 0 356.69634 -nan 26404.024 6.5705214e+53 > ERROR: Out of range atoms - cannot compute PPPM 链接是data文件http://www.rayfile.com/files/3cd ... -8eca-0015c55db73d/ 和in文件 http://www.rayfile.com/files/4ef ... -bc0d-0015c55db73d/ 手册上说是初始结构的问题导致了原子重叠。我做的是NPT模拟，请问有谁知道这个问题应该怎样纠正啊？谢谢了，各位！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂
已经有9人回复
-
博士推荐
已经有6人回复
-
298求调剂
已经有8人回复
-
0856材料求调剂
已经有11人回复
-
311求调剂
已经有7人回复
-
材料学调剂
已经有4人回复
-
面上模板改不了页边距吧？
已经有3人回复
-
高分子化学与物理调剂
已经有5人回复
-
版面费该交吗
已经有18人回复
-
285求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】lammps关于fix ave/spatial命令应用问题
已经有4人回复
- 【求助】lammps中是否有关于Bond-orientational order参数的
已经有3人回复
- 【求助】Lammps使用？
已经有0人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
- 【求助】lammps势的选择
已经有3人回复
- 【求助】lammps模拟聚合物刷如何建模？
已经有1人回复
- 【求助】LAMMPS构造晶界
已经有0人回复
- 【求助】lammps或者dlpoly能否做粗粒化模拟吗？
已经有3人回复
- 【求助】Lammps能做布朗动力学模拟吗？
已经有3人回复
- 【求助】lammps怎么算声子谱？
已经有1人回复
- 【求助】lammps的使用
已经有9人回复
- 【求助】lammps 安装问题
已经有1人回复
- 【求助】Lammps 中加外力的问题
已经有1人回复
- 【求助】LAMMPS中添加Lees-Edwards边界条件
已经有2人回复
- 【求助】lammps这段代码的意思是？
已经有1人回复
- 【求助】lammps计算heat/flux出错
已经有1人回复
- 【求助】lammps如何测量模拟以后材料的晶格参数？
已经有7人回复
- 【求助】LAMMPS－REAX计算出错
已经有3人回复
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格创建问题
已经有14人回复
- 【求助】lammps中消除平动对温度统计的影响问题
已经有2人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
澳大利亚科廷大学招收全奖博士（采矿与冶金工程专业）
+1/277
-
侯旭课题组(化学、化工、环境、能源相关方向)欢迎你的加入
+1/172
-
【最后机会】深圳大学26级土木工程博士急招
+5/95
-
长期招收有色金属、稀土、固体氧化物燃料电池等领域硕士和博士研究生
+1/91
-
长春工业大学化学工程学院招收26年硕士调剂生
+1/80
-
山东理工大学材料学院泰山学者青年专家招收2026年调剂硕士研究生
+1/76
-
26国自然面上，大家是否还写研究方案？
+1/70
-
大连工业大学杰青/长江团队招收储能电池方向博士
+1/40
-
设备故障诊断与预测性维护方向-硕博研究生兼职
+1/37
-
天津科技大学海洋与环境学院殷焕顺团队招硕士、博士研究生——环境分析化学研究领域
+5/25
-
吉林大学张越涛教授团队长期招收博士后、2026年入学博士研究生和科研助理
+1/21
-
安徽农业大学许云辉教授课题组招收材料类、化工类、医学类等工科专硕学硕考研调剂
+1/17
-
中国科学院宁波材料所 极端环境高分子工程材料团队 诚聘博士后
+1/13
-
深圳大学何传新课题组诚聘“百人计划”（副）教授、助理教授
+1/6
-
香港城市大学招聘博士后 (有机合成/催化/流动化学)
+1/5
-
深圳大学何传新课题组诚聘博士后、（副）研究员
+1/4
-
大连理工大学 蒋孟男课题组（国家级高层次青年人才）诚招博士后/科研助理
+1/4
-
哈尔滨理工大学材化学院燕红老师招收调剂生
+1/4
-
合成求助 酯交换关环
+1/3
-
寻求26秋季入学的机械博士名额
+1/1
2楼2012-09-15 10:31:54
★ ★ ★ ★ ★ ★
阿三阿里宝宝(金币+2): 谢谢参与
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-09-17 09:21:16
阿三阿里宝宝(金币+2): 谢谢参与
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-09-17 09:21:16
|
This error occus because atoms are moving too far 解决办法：调小时间步长， 先运行一个 energy minimization 命令 一般运行一段时间之后，如果温度比较高，再出现这样的报错信息，就是because atoms are moving too far 但是在第一步就出现这样“Out of range atoms - cannot compute PPPM”，那么就是模型建立的有问题，检查模型建立的过程，或者重新建模！ |
3楼2012-09-15 17:08:00
4楼2013-01-30 21:46:37
5楼2013-02-08 13:04:59
6楼2013-02-15 10:50:31
8楼2013-11-07 17:06:03
简单回复
jane85567楼
2013-08-20 16:29
回复
阿三阿里宝宝(金币+2): 谢谢参与
