| 查看: 8558 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】LAMMPS运行错误：Out of range atoms - cannot compute PPPM
|
|||
|
运行LAMMPS出现以下内容： LAMMPS (23 Aug 2010) > Scanning data file ... > 4 = max bonds/atom > 6 = max angles/atom > Reading data file ... > orthogonal box = (-3.3562 -3.181 -3.2099) to (26.4202 26.9708 26.1994) > 1 by 1 by 1 processor grid > 1388 atoms > 960 bonds > 688 angles > Finding 1-2 1-3 1-4 neighbors ... > 4 = max # of 1-2 neighbors > 3 = max # of 1-3 neighbors > 3 = max # of 1-4 neighbors > 4 = max # of special neighbors > 1388 atoms in group all > 1128 atoms in group water > 260 atoms in group methane > Finding SHAKE clusters ... > 0 = # of size 2 clusters > 0 = # of size 3 clusters > 0 = # of size 4 clusters > 376 = # of frozen angles > PPPM initialization ... > G vector = 0.30131 > grid = 25 25 24 > stencil order = 5 > RMS precision = 7.38705e-06 > brick FFT buffer size/proc = 38148 15000 17340 > Setting up run ... > Memory usage per processor = 14.4062 Mbytes > Step Temp Press Volume TotEng > 0 356.69634 -nan 26404.024 6.5705214e+53 > ERROR: Out of range atoms - cannot compute PPPM 链接是data文件http://www.rayfile.com/files/3cd ... -8eca-0015c55db73d/ 和in文件 http://www.rayfile.com/files/4ef ... -bc0d-0015c55db73d/ 手册上说是初始结构的问题导致了原子重叠。我做的是NPT模拟，请问有谁知道这个问题应该怎样纠正啊？谢谢了，各位！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
(出分啦!!!)26 考研调剂 20w+调剂信息火速更新中！【捡漏】qq 群：1087823172
已经有79人回复
-
085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂
已经有6人回复
-
311求调剂
已经有6人回复
-
高分子化学与物理调剂
已经有4人回复
-
化工专硕348，一志愿985求调剂
已经有5人回复
-
博士自荐
已经有3人回复
-
求环氧树脂研发1名
已经有11人回复
-
博士推荐
已经有5人回复
-
0856材料求调剂
已经有9人回复
-
285求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】lammps关于fix ave/spatial命令应用问题
已经有4人回复
- 【求助】lammps中是否有关于Bond-orientational order参数的
已经有3人回复
- 【求助】Lammps使用？
已经有0人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
- 【求助】lammps势的选择
已经有3人回复
- 【求助】lammps模拟聚合物刷如何建模？
已经有1人回复
- 【求助】LAMMPS构造晶界
已经有0人回复
- 【求助】lammps或者dlpoly能否做粗粒化模拟吗？
已经有3人回复
- 【求助】Lammps能做布朗动力学模拟吗？
已经有3人回复
- 【求助】lammps怎么算声子谱？
已经有1人回复
- 【求助】lammps的使用
已经有9人回复
- 【求助】lammps 安装问题
已经有1人回复
- 【求助】Lammps 中加外力的问题
已经有1人回复
- 【求助】LAMMPS中添加Lees-Edwards边界条件
已经有2人回复
- 【求助】lammps这段代码的意思是？
已经有1人回复
- 【求助】lammps计算heat/flux出错
已经有1人回复
- 【求助】lammps如何测量模拟以后材料的晶格参数？
已经有7人回复
- 【求助】LAMMPS－REAX计算出错
已经有3人回复
- 【求助】lammps中多元化合物的晶格创建问题
已经有14人回复
- 【求助】lammps中消除平动对温度统计的影响问题
已经有2人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
东北石油大学三亚海洋油气研究院【硕士招生】【地质资源与地质工程】【地质学】
+1/79
-
上海交通大学叶天南课题组招聘2026级博士研究生
+1/76
-
西工大控制科学博后招聘
+1/42
-
【博士招生】北方工业大学招收机械工程方向申请考核制博士
+1/39
-
湖南大学材料院陶益杰老师招收2026年秋季入学博士生一名-超材料方向
+1/37
-
哈工大 化工学院招26级博士生（钙钛矿太阳能电池/传感器方向）
+1/35
-
同济大学 环境科学与工程学院 国家级青年人才团队 诚聘脱产博士后
+1/29
-
中国科学院宁波材料所 极端环境高分子工程材料团队 诚聘博士后
+1/13
-
南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士
+1/12
-
深圳理工大学刘鑫课题组高薪招聘博士后
+1/8
-
电子科技大学材料学院可持续发展未来技术创新中心招收博士生及科研助理
+1/7
-
湖北工业大学2026年博士研究生（生物医药专博+轻工技术与工程学博）
+1/5
-
重医大-药学院-药学化学26级博士招生
+1/5
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
+1/5
-
【全奖博士招生】美国科罗拉多大学科罗拉多斯普林斯分校----固体与结构力学
+1/4
-
济南大学耿兵氟化学课题组现招收2026级化学工程学硕专硕共4名
+1/4
-
大连理工大学 蒋孟男课题组（国家级高层次青年人才）诚招博士后/科研助理
+1/4
-
中科院合肥物质研究院招聘水系锌电博士后（长期有效）诚聘海内外优秀博士后
+1/2
-
【科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/2
-
武汉纺织大学全国重点实验室吕永钢教授招收硕士研究生
+1/2
5楼2013-02-08 13:04:59
2楼2012-09-15 10:31:54
★ ★ ★ ★ ★ ★
阿三阿里宝宝(金币+2): 谢谢参与
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-09-17 09:21:16
阿三阿里宝宝(金币+2): 谢谢参与
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2012-09-17 09:21:16
|
This error occus because atoms are moving too far 解决办法：调小时间步长， 先运行一个 energy minimization 命令 一般运行一段时间之后，如果温度比较高，再出现这样的报错信息，就是because atoms are moving too far 但是在第一步就出现这样“Out of range atoms - cannot compute PPPM”，那么就是模型建立的有问题，检查模型建立的过程，或者重新建模！ |
3楼2012-09-15 17:08:00
4楼2013-01-30 21:46:37
