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【求助/交流】PCR产物的琼脂糖电泳图片
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hhb7610076
金虫
(正式写手)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 591.8
帖子: 463
在线: 53.4小时
虫号: 774727
[交流]
【求助/交流】PCR产物的琼脂糖电泳图片
这是用3个DNA模板对14对
SSR
引物的PCR产物的电泳图。
用的是20微升的体系
buffer 2微升
mg(2.5mM) 2微升
dDTP(2.5mM) 1.5微升
模板 1微
引物(10um) 上游 1微升
下游 1微升
Taq 1U
退火温度我用的温度范围
为什么同一引物有的出有的不出,麻烦大家帮看一下引物能用吗?
体系还有什么问题。谢谢了!
这是DNA的电泳图。
[
Last edited by hhb7610076 on 2010-12-21 at 09:39
]
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rioarsenal
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引用回帖:
Originally posted by
hhb7610076
at 2010-12-20 12:32:34:
引物是文献上查的,ssr 做遗传多样性的。 不知道产物浓度行不行?
偶,楼主DNA的电泳图么,上来看看啊
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12楼
2010-12-20 13:13:24
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haitian0625
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★
hhb7610076(金币
+1
):谢谢参与
是否应该自己做一下小试,摸一下退火温度呢,合适的退火温度也是PCR的条件之一啊,合适了才可能清晰的,当然不要求产物浓度也无所谓。
不知你模板浓度有多少,模板有些少吧。
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2楼
2010-12-19 20:48:11
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rioarsenal
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★
hhb7610076(金币
+1
):谢谢参与
这么多引物,首先应该用primer等软件看看是否符合做引物的条件,然后再选出合适的来做梯度PCR,确定比较合适的条件。
不知道楼主做这个实验的目的是什么
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4楼
2010-12-20 02:50:04
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rechkov
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★
hhb7610076(金币
+1
):谢谢参与
我的经验呢,DNA质量对引物的扩增效率是有很大影响的,所以在相通扩增条件下,三个DNA模板的扩增效果是有很大差异的。这里你只说模板是1微升,太不精细了,你应该首先给DNA定量,然后稀释到大约相同的浓度,做SSR一般50到100纳克DNA就够了,太多了有时反而扩增不出来。
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5楼
2010-12-20 05:07:37
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