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【求助/交流】荧光定量 有DNA污染
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pidou213
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【求助/交流】荧光定量 有DNA污染
咋办呢?
我怕经过DNA酶处理一下后,RNA恐怕就讲解完了
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2010-11-17 00:06:03
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dhd997(金币+1):鼓励交流 2010-11-17 08:33:03
pidou213(金币+1):xianxiexie 2010-11-17 23:45:53
不会的,只要用RNase free 的DNase处理,不会降解RNA的。
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2楼
2010-11-17 08:32:26
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lstt09nk(金币+1):鼓励交流 2010-11-17 11:17:31
那个DNA要想完全去除是不现实的,关键是要找到为什么污染和污染源在哪里,这样才是办法。
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3楼
2010-11-17 09:45:58
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Originally posted by
lixg
at 2010-11-17 08:32:26:
不会的,只要用RNase free 的DNase处理,不会降解RNA的。
可是操作起来会不会降解的很快呢
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4楼
2010-11-17 23:45:21
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silicare(金币+1):DNA污染是不可避免的,也是无法根除的,多多少少都会有残余的,多了只能消化 2010-11-18 08:12:00
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Originally posted by
bigboy123
at 2010-11-17 09:45:58:
那个DNA要想完全去除是不现实的,关键是要找到为什么污染和污染源在哪里,这样才是办法。
你的意思是完全无法去除DNA吗?
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5楼
2010-11-17 23:45:42
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这个主要是荧光PCR敏感性太高了,有点就能检测出。要是PCR产物的污染还有办法,要是混在样本中则得废弃样本了,所以关键要搞清楚为什么出现污染和污染源在哪里。
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6楼
2010-11-18 09:40:52
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lstt09nk(金币+1):鼓励交流 2010-11-19 10:50:10
pidou213(金币+1):谢谢啊 2010-11-20 00:52:54
哪有这么复杂啊。trizol法提取RNA后,通行的做法都是用RNase free 的DNase处理,去除基因组污染。然后进行反转录。如果还不放心,就在内含子上设计一对内参引物(跨外显子),用反转录产物做个PCR,35个循环,电泳检测,如无目的条带,就可以了。
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7楼
2010-11-19 10:44:34
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yidaqunyan
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pidou213(金币+2):谢谢啊,能否告知在哪里买比较好? 2010-11-20 00:52:45
买一个双提的试剂盒,效果比较好,直接DNA就被吸附了
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8楼
2010-11-19 11:16:05
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cyz20050505
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Originally posted by
pidou213
at 2010-11-17 00:06:03:
咋办呢?
我怕经过DNA酶处理一下后,RNA恐怕就讲解完了
你怎么判断是DNA污染,贴图出来看下嘛
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9楼
2010-11-19 16:04:14
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lixg
at 2010-11-19 10:44:34:
哪有这么复杂啊。trizol法提取RNA后,通行的做法都是用RNase free 的DNase处理,去除基因组污染。然后进行反转录。如果还不放心,就在内含子上设计一对内参引物(跨外显子),用反转录产物做个PCR,35个循环,电泳 ...
问题出现了非目的条带啊
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10楼
2010-11-20 00:51:58
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Originally posted by
yidaqunyan
at 2010-11-19 11:16:05:
买一个双提的试剂盒,效果比较好,直接DNA就被吸附了
可是很贵啊
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11楼
2010-11-20 00:52:22
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yidaqunyan
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pidou213(金币+3):谢谢啊 物品的是昆虫的 2010-11-21 14:17:24
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Originally posted by
yidaqunyan
at 2010-11-19 11:16:05:
买一个双提的试剂盒,效果比较好,直接DNA就被吸附了
我是用的原平皓的试剂盒,双提的,效果还好,大概一千多一点,五十次,不知道你什么材料
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12楼
2010-11-20 14:46:23
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试剂pH值没有调好,如果pH对于DNA和RNA就容易分开
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13楼
2010-11-21 00:45:38
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提取的RNA必须经过去DNA的,特别是作RT-qPCR。一般;来说都不会出现什么问题的。
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14楼
2010-11-21 03:46:04
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Originally posted by
wangy0908
at 2010-11-21 03:46:04:
提取的RNA必须经过去DNA的,特别是作RT-qPCR。一般;来说都不会出现什么问题的。
我最怕的就是在后期处理中RNA又出现不同程度的降解!~~
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15楼
2010-11-21 14:17:55
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yidaqunyan
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pidou213(金币+1):谢谢你啊 2010-11-22 11:23:25
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Originally posted by
yidaqunyan
at 2010-11-20 14:46:23:
我是用的原平皓的试剂盒,双提的,效果还好,大概一千多一点,五十次,不知道你什么材料
如果你打算用原平皓的试剂盒,我可以帮你联系下
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16楼
2010-11-21 15:40:29
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dhd997(金币+1):鼓励交流 2010-11-22 08:28:48
比较关注这个问题。最近做QPCR,同批次的细胞样品,提RNA,DNA酶消化后反转,之后做定量PCR检测。但是估计是有DNA 基因组消化不完全,实验数据有时偏差蛮大的!不知道如何简单判断基因组消化是否完全
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2010-11-21 19:47:43
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dhd997(金币+1):鼓励交流 2010-11-22 08:28:38
引用回帖:
Originally posted by
pidou213
at 2010-11-21 14:17:55:
我最怕的就是在后期处理中RNA又出现不同程度的降解!~~
不会的,即使降解,所有的基因mRNA也都是同步降解的,也不会影响你的实验结果
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18楼
2010-11-22 01:24:43
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Originally posted by
wangy0908
at 2010-11-22 01:24:43:
不会的,即使降解,所有的基因mRNA也都是同步降解的,也不会影响你的实验结果
但愿如此吧,毕竟没有官方的文件啊,再说,最主要的是怕操作过程中的污染,到最后可能会导致得不偿失啊
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19楼
2010-11-22 11:24:08
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