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apple6299

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】为何定量PCR扩增曲线不规则 已有6人参与

各位兄弟姐妹,Taq-Man法检测我的目的基因,内参扩增曲线正常,但是目的基因扩增曲线不光滑,是什么原因啊?
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apple6299

铁杆木虫 (正式写手)

                            如图

[ Last edited by apple6299 on 2010-10-16 at 17:18 ]
2楼2010-10-16 17:17:16
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sn198651

银虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):感谢参与 2010-10-16 19:06:42
你的是一步法还是两步法啊
加体系的时候会不会离心管里有气泡

如果气泡很多 曲线肯定不规则
3楼2010-10-16 18:37:50
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taigongzaici

新虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+2):谢谢交流。 2010-10-17 09:59:29
1.加样不准确
2。气泡作祟
3,你这是一个模板的重复?还是不同模板你没做重复,只是预实验


建议
1,换成好的枪头和八连管,建议AXYGEN
2,多做重复,最少五个,保证准确性,也可以修正的余地
3,混合分装一定要均匀,这是非常非常重要的,特别是模板!!!!
4,八连管的摆放位置,和你设计的程序一定要吻合
4楼2010-10-17 09:07:49
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apple6299

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by apple6299 at 2010-10-16 17:17:16:
                            如图

[ Last edited by apple6299 on 2010-10-16 at 17:18 ]

是两步法,先提RNA反转成cDNA之后,才用我的目的基因进行扩增的!因为瞬时离心后,确保反应液全部在毛细管下部,可以排除毛细管有气泡的因素
5楼2010-10-17 12:32:53
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apple6299

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by sn198651 at 2010-10-16 18:37:50:
你的是一步法还是两步法啊
加体系的时候会不会离心管里有气泡

如果气泡很多 曲线肯定不规则

是两步法,先提RNA反转成cDNA之后,才用我的目的基因进行扩增的!因为瞬时离心后,确保反应液全部在毛细管下部,可以排除毛细管有气泡的因素
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2496005
6楼2010-10-17 12:34:00
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apple6299

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by taigongzaici at 2010-10-17 09:07:49:
1.加样不准确
2。气泡作祟
3,你这是一个模板的重复?还是不同模板你没做重复,只是预实验


建议
1,换成好的枪头和八连管,建议AXYGEN
2,多做重复,最少五个,保证准确性,也可以修正的余地
3,混合分 ...

这个只是预实验,不同模板的,后来每个模板做了3哥重复,还是出现如此状况。我的实验步骤是先把体系的其他样全部加在同一个EP管,然后进行分装,最后加不同的模板(模板量是一样的,加5ul,因为模板稀释过)。反应管不是八连管,只是进口的单个毛细管。机子是罗氏的LightCycler2.0.
7楼2010-10-17 12:39:36
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sn198651

银虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1):欢迎回帖交流 2010-10-21 21:35:09
2步法的FQ-PCR没做过
我现在都是用一步法的做

2步法的我们只用在常规RT-PCR中
是不是手提RNA不稳定的原因 测过浓度么
8楼2010-10-21 21:14:17
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silicare

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优秀版主

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
CT值稍稍的有一点点的高

把你的重复情况发上来看看,复孔怎么样?
9楼2010-10-22 08:40:30
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love_st

金虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-22 09:52:12
浓度很低,看这情况都只有10的三次方拷贝,曲线当然不会很光滑
10楼2010-10-22 09:08:21
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