24小时热门版块排行榜    

查看: 1956  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

thh2008

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】完整ORF判断的软件 已有7人参与

请问一下大家,有没有哪个网址或软件可以判断所克隆的ORF是否是完整的?谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+5):热心~~~ 2010-10-14 22:27:30
这个图的意思是:

在判定ORF时,因为序列方向的不定性,所以程序会从正反两端做查找。

根据密码子的三联体特性,所以查找时会移码查找,以下面这段序列为例

aatttaaaaatttaattt正向有三个起始法:aat,att,ttt;反向也同样有三种:ttt,tta,taa。

从你的这个结果来看,长度为1785的那个+3,在图上是你的绿色条最长的那个是一

个完整的ORF,当然剩下的绿条部分都是,但是这个最长,所以最有可能是你的目的

基因。

不知道我表述清楚了没,
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
9楼2010-10-14 22:04:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
1949stone(金币+1):鼓励 2010-10-16 19:10:33
Google里面搜索 ORFinder ,我最喜欢用的是这个。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-10-08 16:28:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

thh2008

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-08 16:28:35:
Google里面搜索 ORFinder ,我最喜欢用的是这个。

请问用这个查找了之后,怎么判定它就是complate CDS呢?
4楼2010-10-13 17:43:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
根据起始密码子和终止密码子确定。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
5楼2010-10-13 20:21:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 336求调剂 +4 rmc8866 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:48 by macy2011
[考研] 材料学硕301分求调剂 +4 Liyouyumairs 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:01 by 18337163304
[考研] 求助 +4 梦里的无言 2026-03-21 5/250 2026-03-21 15:53 by ColorlessPI
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 南昌大学材料专硕311分求调剂 +6 77chaselx 2026-03-20 6/300 2026-03-21 07:24 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +8 小材化本科 2026-03-18 8/400 2026-03-20 23:16 by JourneyLucky
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿苏州大学材料求调剂,总分315(英一) +5 sbdksD 2026-03-19 5/250 2026-03-20 22:10 by luoyongfeng
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 085601专硕,总分342求调剂,地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
信息提示
请填处理意见