[交流] 【求助/交流】完整ORF判断的软件已有7人参与

Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-08 16:28:35:
Google里面搜索 ORFinder ，我最喜欢用的是这个。

Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-13 20:21:33:
根据起始密码子和终止密码子确定。

Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-14 08:46:39:



至少原核基因是这样的，真核的话有上游序列可能遗漏。

Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-14 22:04:48:
这个图的意思是：

在判定ORF时，因为序列方向的不定性，所以程序会从正反两端做查找。

根据密码子的三联体特性，所以查找时会移码查找，以下面这段序列为例

aatttaaaaatttaattt正向有三个起始法：aat,at ...

Originally posted by thh2008 at 2010-10-14 20:59:15:

   
能帮我看看吗？我有点看不懂

Originally posted by brightfuture01 at 2010-10-17 10:15:23:



是的，呵呵， frame不就是ORF的F么，就是开读框的意思啊，+3是正向第三种读码方式的。