24小时热门版块排行榜    

查看: 1648  |  回复: 8

mengmenglu

金虫 (小有名气)

[求助] ORF老是扩不出来

各位大虾,最近遇到点问题。之前扩全长已扩完,最近做表达,要把ORF片段连到PET载体上。根据ORF设计了引物,上游引物GC含量比较低,只有25%。用此引物扩CDNA时,片段大小符合,回收,连接,转化后测序,发现测序结果只有其中一条引物匹配,要么上游引物,要么下游引物,除此之外其他的碱基都不能匹配。做了好多次了,都扩不出来。后来又用了 LA Taq酶,也不行。谁能给支支招啊,这一个表达做了好几个月了,就在ORF这里卡住了。可以肯定的是ORF序列没问题。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

camen

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
mengmenglu(金币+1): 2011-08-22 22:25:31
看天(金币+3): 新人鼓励 2011-08-23 08:28:43
mengmenglu(金币+1): 谢谢 2011-09-09 17:00:48
mengmenglu(金币+3): 2011-10-07 17:47:05
最大可能就是你引物有问题,如果你从基因组里扩增,很可能是出现了错配。
你的PCR产物跑胶时又没有杂带或者弥散?
首先调整PCR条件,看能不能得到特异性产物。
不行的话重新设计引物
2楼2011-08-22 21:42:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengmenglu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by camen at 2011-08-22 21:42:17:
最大可能就是你引物有问题,如果你从基因组里扩增,很可能是出现了错配。
你的PCR产物跑胶时又没有杂带或者弥散?
首先调整PCR条件,看能不能得到特异性产物。
不行的话重新设计引物

我的引物是根据ORF序列来设计的,一头一尾,都加了酶切位点的,没办法改变了,每次PCR扩增都有条带,而且条带大小也符合,也没有什么非特异性条带。但是回收后连接转化测序就得不到想要的东西。可能只能再优化PCR条件了。谢谢你!
3楼2011-08-22 22:28:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

780871756

新虫 (初入文坛)

我也是这样啊,,,,
aa
4楼2011-10-18 12:47:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wlwabcd

铜虫 (正式写手)

同求!我的5'端是GCrich区,3'端是ATrich区。有没有什么好办法可以解决。推荐几个好点的酶也可以,谢谢!
5楼2011-10-18 15:47:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jasco

木虫 (正式写手)

有个复杂点的办法:
分析序列,看看能不能找到合适的酶切微点,分成两段做,先扩一段并放入pet载体得到一个中间载体,然后再扩后面一段再放入中间载体
6楼2011-10-19 21:59:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengmenglu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wlwabcd at 2011-10-18 15:47:41:
同求!我的5'端是GCrich区,3'端是ATrich区。有没有什么好办法可以解决。推荐几个好点的酶也可以,谢谢!

我的已经解决了。经分析,是引物的问题。之前我的上下游引物都是20bp的,后来我把上下游引物均增加到30bp,一次性搞定,现在表达都要做完了。呵呵,大伙,加油啊!
7楼2011-10-21 20:17:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengmenglu

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 780871756 at 2011-10-18 12:47:25:
我也是这样啊,,,,

你也重新设计引物试试吧。
8楼2011-10-21 20:17:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

曦曦木语

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mengmenglu at 2011-10-21 20:17:06
我的已经解决了。经分析,是引物的问题。之前我的上下游引物都是20bp的,后来我把上下游引物均增加到30bp,一次性搞定,现在表达都要做完了。呵呵,大伙,加油啊!...

我遇到了相同的问题,不过我的引物都30多bp了,每次都有条带,但是就是连不上载体,心好累
9楼2018-01-13 13:47:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mengmenglu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 272求调剂 +3 材紫有化 2026-02-28 3/150 2026-02-28 22:52 by ms629
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +4 弗格个 2026-02-28 6/300 2026-02-28 22:00 by wang_dand
[考研] 292求调剂 +3 yhk_819 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:57 by gaoxiaoniuma
[考研] 295求调剂 +5 19171856320 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:39 by gaoxiaoniuma
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 264求调剂 +3 巴拉巴拉根556 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:31 by gaoxiaoniuma
[考研] 材料类求调剂 +6 wana_kiko 2026-02-28 6/300 2026-02-28 21:20 by gaoxiaoniuma
[考研] 求调剂 +4 repeatt?t 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:16 by gaoxiaoniuma
[考研] 284求调剂 +4 天下熯 2026-02-28 4/200 2026-02-28 21:13 by gaoxiaoniuma
[考研] 高分子化学与物理调剂 +4 好好好1233 2026-02-28 7/350 2026-02-28 20:42 by 好好好1233
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂;
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[基金申请] 面上可以超过30页吧? +12 阿拉贡aragon 2026-02-22 13/650 2026-02-26 22:09 by Hahaxia
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见