应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何判断一段CDNA是否是完整的
51/1返回列表
查看: 1944  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

glgno1

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何判断一段CDNA是否是完整的

各位前辈好，我最近扩了一段基因序列的全长，想请教下大家如何判断该基因是否已经扩完整了，老师说开放阅读框必须是连续的，但是最近研究发现其也有开放阅读框是断断续续的，但是其它物种该基因是完整的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
glgsno1
1楼 2012-03-03 20:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kongraty

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个还真没有做过，期待高手指点。
赞一下 回复此楼
很想努力上进，争取人生辉煌！
2楼2012-03-04 10:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
cDNA？
为什么不自己分离mRNA？真核生物的mRNA不是很好分离吗？然后找到TSP，这样不就可以确定其完整性了吗？但是，是不是还有转录后修饰呢？
赞一下 回复此楼
致良知
3楼2012-03-04 13:58:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juchi_123

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:41
是不是可以在NCBI中进行BlastP，然后看看其他物种的相关基因编码的氨基酸序列是不是和你的差不多大，如果是的话，应该就是最大的ORF。另外也存在你说另外一种情况，就是ORF是断断续续的。我们这就碰到了这个现象。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-03-05 00:11:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

22148942

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:57
1、首先要根据你了解的，预测下基因的长度，达到你预期的长度，可以用软件辅助判断。
2、把基因测序的结果放到NCBI中的OFRfinder软件中，如果结果中出现连续的、最长的一段区域，应该是一个完整的编码区。
3、单击软件中的氨基酸相关分析，可以再次与编码相关基因的氨基酸序列进行比对，进一步确定。
赞一下 回复此楼
5楼2012-03-05 10:52:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 glgno1 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0703化学调剂，求各位老师收留 +7 秋有木北 2026-03-14 7/350 2026-03-15 17:30 by 小物理化学
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 材料与化工 一志愿山大 321分 求调剂 +7 每天散步 2026-03-09 8/400 2026-03-14 02:18 by JourneyLucky
[考研] 一志愿湖师大化学289求调剂 +6 XMCMM3.14159 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:28 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] b区环境工程求调剂 +4 Maps1 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:23 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[论文投稿] 投稿问题 5+4 星光灿烂xt 2026-03-12 6/300 2026-03-13 14:17 by god_tian
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 083000环境科学与工程调剂 +8 mingmingry 2026-03-09 9/450 2026-03-11 10:23 by 沙漠之狐994
[考研] 294 英二数二物化 求调剂 +6 米饭团不好吃 2026-03-09 6/300 2026-03-09 23:55 by barlinike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭