应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何判断一段CDNA是否是完整的
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1973  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

glgno1

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何判断一段CDNA是否是完整的

各位前辈好，我最近扩了一段基因序列的全长，想请教下大家如何判断该基因是否已经扩完整了，老师说开放阅读框必须是连续的，但是最近研究发现其也有开放阅读框是断断续续的，但是其它物种该基因是完整的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
glgsno1
1楼 2012-03-03 20:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kongraty

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个还真没有做过，期待高手指点。
赞一下 回复此楼
很想努力上进，争取人生辉煌！
2楼2012-03-04 10:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
cDNA？
为什么不自己分离mRNA？真核生物的mRNA不是很好分离吗？然后找到TSP，这样不就可以确定其完整性了吗？但是，是不是还有转录后修饰呢？
赞一下 回复此楼
致良知
3楼2012-03-04 13:58:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juchi_123

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:41
是不是可以在NCBI中进行BlastP，然后看看其他物种的相关基因编码的氨基酸序列是不是和你的差不多大，如果是的话，应该就是最大的ORF。另外也存在你说另外一种情况，就是ORF是断断续续的。我们这就碰到了这个现象。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2012-03-05 00:11:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

22148942

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:57
1、首先要根据你了解的，预测下基因的长度，达到你预期的长度，可以用软件辅助判断。
2、把基因测序的结果放到NCBI中的OFRfinder软件中，如果结果中出现连续的、最长的一段区域，应该是一个完整的编码区。
3、单击软件中的氨基酸相关分析，可以再次与编码相关基因的氨基酸序列进行比对，进一步确定。
赞一下 回复此楼
5楼2012-03-05 10:52:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 glgno1 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料求调剂 +11 一样YWY 2026-04-05 11/550 2026-04-05 23:36 by 来看流星雨10
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 11/550 2026-04-05 22:13 by 醉翁wl
[考研] 工科08-机械专硕-求调剂 +3 雷欧飞踢 2026-04-02 3/150 2026-04-05 18:49 by 蓝云思雨
[考研] 070300化学求调剂 +17 小黄鸭宝 2026-03-30 17/850 2026-04-05 12:03 by 宁馨哈哈
[考研] 可跨专业调剂 +3 周的得地 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:21 by barlinike
[考研] 316求调剂 +9 墨辰_Orion926 2026-04-04 9/450 2026-04-04 21:35 by lbsjt
[考研] 278求调剂 +3 依旧！ 2026-04-02 4/200 2026-04-04 20:27 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +3 上海大学346调剂 2026-04-03 3/150 2026-04-04 20:20 by dongzh2009
[考研] 求调剂，一志愿南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-04-03 10/500 2026-04-04 09:01 by T可可西里T
[考研] 357求调剂 +13 1050389037 2026-04-03 13/650 2026-04-03 22:27 by 无际的草原
[考研] 322求调剂 +6 FZAC123 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:23 by 科研小专家
[考研] 274求调剂 +9 顺理成张 2026-04-03 10/500 2026-04-03 15:10 by 啊俊！
[考研] 11408，284分，二战真诚求调剂 +4 12.27 2026-04-02 4/200 2026-04-03 14:14 by dxiaoxin
[考研] 初试成绩337找调剂 +3 ??? ?. ? 2026-04-03 3/150 2026-04-03 11:43 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业（专硕）300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 化学070300-总分378-求调剂 +5 挪椅子的泡泡糖 2026-04-02 5/250 2026-04-02 22:20 by ZXlzxl0425
[考研] 085600，320分求调剂 +6 大馋小子 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:54 by dongzh2009
[考研] 377求调剂 +3 RASKIN 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:45 by zzchen2000
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 285求调剂 +7 AZMK 2026-03-30 13/650 2026-04-01 17:00 by 七度不信任
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭