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glgno1

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何判断一段CDNA是否是完整的

各位前辈好,我最近扩了一段基因序列的全长,想请教下大家如何判断该基因是否已经扩完整了,老师说开放阅读框必须是连续的,但是最近研究发现其也有开放阅读框是断断续续的,但是其它物种该基因是完整的。
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新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:57
1、首先要根据你了解的,预测下基因的长度,达到你预期的长度,可以用软件辅助判断。
2、把基因测序的结果放到NCBI中的OFRfinder软件中,如果结果中出现连续的、最长的一段区域,应该是一个完整的编码区。
3、单击软件中的氨基酸相关分析,可以再次与编码相关基因的氨基酸序列进行比对,进一步确定。
5楼2012-03-05 10:52:35
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