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glgno1

新虫 (初入文坛)

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[求助] 如何判断一段CDNA是否是完整的

各位前辈好，我最近扩了一段基因序列的全长，想请教下大家如何判断该基因是否已经扩完整了，老师说开放阅读框必须是连续的，但是最近研究发现其也有开放阅读框是断断续续的，但是其它物种该基因是完整的。

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glgsno1

1楼 2012-03-03 20:21:51

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juchi_123

铜虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

★
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小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-03-05 11:09:41

是不是可以在NCBI中进行BlastP，然后看看其他物种的相关基因编码的氨基酸序列是不是和你的差不多大，如果是的话，应该就是最大的ORF。另外也存在你说另外一种情况，就是ORF是断断续续的。我们这就碰到了这个现象。

赞一下(1人)

4楼2012-03-05 00:11:44

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