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hustxiong

木虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 4103.9
散金: 120
帖子: 328
在线: 99.5小时
虫号: 62816
注册: 2005-04-02
性别: GG
专业: 环境微生物学

[交流] 【求助/交流】关于DGGE，求助

最近初做DGGE，银染后，图谱如下：
（1）点了两个样，每个样两个平行，图中A1,A2 和BI,B2，为何其他泳道也扩散严重，胶制好后过夜室温干燥的。样品量是16微升。缓冲室1*TAE，60度，130V，8.5个小时。
(2) A、B样品实质是同一个样品中提取DNA后，一个用V3区引物，一个用是是V6-V8区引物。
（3）图谱最上面的弧形，难道是边缘效应？
高手请帮助下，非常感谢！

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1楼 2010-08-28 15:20:54

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zhang226296

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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在线: 16.4小时
虫号: 2149506
注册: 2012-11-26
专业: 环境微生物学

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

8楼: Originally posted by koven at 2011-09-16 11:02:35
做DGGE，我也遇到，条带不清晰地问题。
本人研究环境细菌，16s V3区，引物为GC-341F和534R，PCR条带很亮。
DGGE条件为：10%胶浓度，40%-60%，60V，15h，EB染色25min。
之前有几次跑的很不错，但是最近又陷入泥 ...

我用的也是这个引物，但是是8%的胶浓度，总是跑不出来好的条带，条带都很少，为什么你用10%的啊，之后跑出来怎么样啊，求赐教，我快被折磨死了