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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

[交流] 【求助/交流】关于变性梯度凝胶电泳(DGGE)已有10人参与

大家有做DGGE的吗?做的好吗,或者参加过什么好的DGGE方面的培训班,希望能不另赐教,我做了一年了,一点都不好眼看着都不能毕业了,先谢谢各位了。把握最近做的一张DGGE电泳图贴上来,请大家指点一下。
这是土壤中细菌16S rDNA的V3片段DGGE电泳分离照片:
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2010-06-20 18:11:38:
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。

我觉得你这个做得还算不错了,你把点样量稍微加大点看看,另外,如果你不是为了回收测序,主要是想看多态性的话,那我建议你银染一下,效果比SYBR GREEN好。银染的条带不能回收,但是你可以用银染的图对照着来切SYBR GREEN染的胶,即使条带不好,可以将切回来的继续PCR,总之最后要纯化成单一条带,才能测序

[ Last edited by yujiaping1 on 2010-6-21 at 14:13 ]
8楼2010-06-21 14:12:35
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xyls6868

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看着还可以吧,就是点样孔很亮啊呵呵
2楼2010-06-20 16:58:04
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yujiaping1

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你这个图,是用什么染色的?
3楼2010-06-20 16:58:58
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月月大可

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。
4楼2010-06-20 18:11:38
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-06-20 16:58:58:
你这个图,是用什么染色的?

用SYBR Green Ⅰ
5楼2010-06-21 09:26:38
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2010-06-20 18:11:38:
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。

你好,你觉得主要原因是什么导致的条带不清晰和条带差异不明显?谢谢!
6楼2010-06-21 09:33:00
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琴瑟不鸣

铁虫 (小有名气)

你用的胶浓度是多少啊?
老虎
7楼2010-06-21 11:19:58
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

引用回帖:
Originally posted by 琴瑟不鸣 at 2010-06-21 11:19:58:
你用的胶浓度是多少啊?

30-60%
9楼2010-06-21 14:45:31
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

引用回帖:
我觉得你这个做得还算不错了,你把点样量稍微加大点看看,另外,如果你不是为了回收测序,主要是想看多态性的话,那我建议你银染一下,效果比SYBR GREEN好。银染的条带不能回收,但是你可以用银染的图对照着来 ...

谢谢你的回答,我想问一下如果要测序的话,切胶的原则是什么?是所有条带都切,还是只切有变化和差异的?谢谢
10楼2010-06-21 14:49:47
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