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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于变性梯度凝胶电泳(DGGE)
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉

[交流] 【求助/交流】关于变性梯度凝胶电泳(DGGE) 已有10人参与

大家有做DGGE的吗？做的好吗，或者参加过什么好的DGGE方面的培训班，希望能不另赐教，我做了一年了，一点都不好眼看着都不能毕业了，先谢谢各位了。把握最近做的一张DGGE电泳图贴上来，请大家指点一下。
这是土壤中细菌16S rDNA的V3片段DGGE电泳分离照片：
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1楼 2010-06-20 16:54:33
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2010-06-20 18:11:38:
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。

我觉得你这个做得还算不错了，你把点样量稍微加大点看看，另外，如果你不是为了回收测序，主要是想看多态性的话，那我建议你银染一下，效果比SYBR GREEN好。银染的条带不能回收，但是你可以用银染的图对照着来切SYBR GREEN染的胶，即使条带不好，可以将切回来的继续PCR，总之最后要纯化成单一条带，才能测序

[ Last edited by yujiaping1 on 2010-6-21 at 14:13 ]
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8楼2010-06-21 14:12:35
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普通回帖

xyls6868

新虫 (小有名气)
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看着还可以吧，就是点样孔很亮啊呵呵
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2楼2010-06-20 16:58:04
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你这个图，是用什么染色的？
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3楼2010-06-20 16:58:58
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。
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4楼2010-06-20 18:11:38
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉
引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-06-20 16:58:58:
你这个图，是用什么染色的？

用SYBR Green Ⅰ
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5楼2010-06-21 09:26:38
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉
引用回帖:
Originally posted by 月月大可 at 2010-06-20 18:11:38:
单个条带不清晰
还看不到明显的差异条带。

你好，你觉得主要原因是什么导致的条带不清晰和条带差异不明显？谢谢！
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6楼2010-06-21 09:33:00
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琴瑟不鸣

铁虫 (小有名气)
你用的胶浓度是多少啊？
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老虎
7楼2010-06-21 11:19:58
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉
引用回帖:
Originally posted by 琴瑟不鸣 at 2010-06-21 11:19:58:
你用的胶浓度是多少啊？

30-60%
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9楼2010-06-21 14:45:31
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clearth

木虫之王 (正式写手)

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引用回帖:
我觉得你这个做得还算不错了，你把点样量稍微加大点看看，另外，如果你不是为了回收测序，主要是想看多态性的话，那我建议你银染一下，效果比SYBR GREEN好。银染的条带不能回收，但是你可以用银染的图对照着来 ...

谢谢你的回答，我想问一下如果要测序的话，切胶的原则是什么？是所有条带都切，还是只切有变化和差异的？谢谢
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10楼2010-06-21 14:49:47
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