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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】关于变性梯度凝胶电泳(DGGE)
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hitliutao

银虫 (小有名气)
★
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土壤微生物成份太复杂导致你的图中条带太多太杂，应该先选择性培养一下再做，不知道楼主的实验目的是什么。
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11楼2010-06-21 14:53:25
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clearth

木虫之王 (正式写手)

专业智能视频监控、工业视觉
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Originally posted by hitliutao at 2010-06-21 14:53:25:
土壤微生物成份太复杂导致你的图中条带太多太杂，应该先选择性培养一下再做，不知道楼主的实验目的是什么。

分析农药对土壤微生物群落结构的影响，所以要知道所有的微生物，这只是细菌的，放线菌和真菌是另外做的。
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12楼2010-06-21 15:23:56
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bsm

银虫 (初入文坛)
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引用回帖:
Originally posted by clearth at 2010-06-21 14:49:47:

我想问一下如果要测序的话，切胶的原则是什么？是所有条带都切，还是只切有变化和差异的？谢谢

根据亮度强弱判断优势和劣势菌群，把共同的优势种群及差异性较大的进行切胶测序！
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13楼2010-06-21 15:58:35
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yujiaping1

木虫 (著名写手)
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Originally posted by clearth at 2010-06-21 14:49:47:

谢谢你的回答，我想问一下如果要测序的话，切胶的原则是什么？是所有条带都切，还是只切有变化和差异的？谢谢

这样看你的实验目的了，你要是想知道土壤细菌的所有种类，当然是测得越多越好
如果你有其他更明确的实验目的，那就根据情况测序了。

我们实验室以前有人做养殖池塘底泥和水中细菌的，就是尽可能多的测
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14楼2010-06-21 16:11:14
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月月大可

木虫 (著名写手)
★
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我没有做过，只是原来见过一师姐经常做根系土壤的，也见她测序，但是不清楚她具体测那些。
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15楼2010-06-21 19:00:50
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5018

铁虫 (初入文坛)

求助

★
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我用银染色的 但是显色后条带很不清晰，大部分胶体也还是白色的，请问这是什么原因。  还有就是银染后能不能进行切胶回收测序吗？ 请高手们指点一二。 小弟不胜感激
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一杯香茗，一卷书，偷得半日闲散；一抹斜阳，一壶酒，愿求半世逍遥。
16楼2010-11-25 14:12:32
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孙盛楠

木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by yujiaping1 at 2010-06-21 14:12:35:


我觉得你这个做得还算不错了，你把点样量稍微加大点看看，另外，如果你不是为了回收测序，主要是想看多态性的话，那我建议你银染一下，效果比SYBR GREEN好。银染的条带不能回收，但是你可以用银染的图对照着来 ...

你好，请问如果最后测序的条带不是单一的，就是杂合的，得到的序列能和BANK里的进行比对吗？
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17楼2011-01-04 19:49:53
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依然肥鹅

新虫 (初入文坛)
我的胶还不凝呢
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18楼2015-06-10 19:31:08
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