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DGGE过程中两条位置不同的条带代表同一菌种现象
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| 各位做DGGE的前辈们，我在做DGGE时，同是嗜热链球菌但来源不同，DGGE后出现的条带在不同位置上，距离差异较大，但细菌通用引物F357GC/R518扩增同一种菌的条带位置理论上应该一致，出现这种现象的原因都有哪些呢？是存在多个克隆子？还有？ |
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xiadongliang
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【答案】应助回帖
王营wy(金币+1): 谢谢，但DGGE只能对不同种进行区分，同一种菌不同株在DGGE区分时按道理说应该是迁移位置一样的啊！ 2011-07-31 20:46:57
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这主要是关于DGGE的原理，DGGE是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化，从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。特定的双链DNA片段在含有从低到高的线性变性剂梯度的聚丙烯酰胺凝胶中电泳，随着电泳的进行，DNA片段向高浓度变性剂方向迁移，当它到达其变性要求的最低浓度变性剂处，双链DNA形成部分解链状态，这就导致其迁移速率变慢，由于这种变性具有序列特异性，因此DGGE能将同样大小的DNA片段很理想地分开. 总之，DGGE就是将同样大小的DNA片段分开，你用细菌通用引物P完再跑核酸胶的话大小肯定一样，但DGGE胶条带位置肯定不同。 |
6楼2011-07-25 21:37:26
