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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » DGGE过程中两条位置不同的条带代表同一菌种现象
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王营wy

新虫 (初入文坛)

[求助] DGGE过程中两条位置不同的条带代表同一菌种现象

各位做DGGE的前辈们，我在做DGGE时，同是嗜热链球菌但来源不同，DGGE后出现的条带在不同位置上，距离差异较大，但细菌通用引物F357GC/R518扩增同一种菌的条带位置理论上应该一致，出现这种现象的原因都有哪些呢？是存在多个克隆子？还有？
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阳光总在风雨后
1楼2011-07-20 22:26:22
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王营wy

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2011-07-21 12:42:28:
理认上DGGE，几个碱基的区别就可以分开，那样的话，正常啊，你的不同的菌，序列不一样不是正常的吗？

谢谢~~
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阳光总在风雨后
5楼2011-07-25 08:33:17
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

有这种情况。有多一个菌的PCR跑完DGGE都能显示两条带。
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王营wy
2楼2011-07-21 08:55:26
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王营wy

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by xiadongliang at 2011-07-21 08:55:26:
有这种情况。有多一个菌的PCR跑完DGGE都能显示两条带。

你好，非常感谢你的回复。我现在的情况是两个菌都属于嗜热，但每个单菌只跑出一条带，而这两条带的位置不同，请问您遇到过这种情况吗？
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阳光总在风雨后
3楼2011-07-21 09:39:27
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
理认上DGGE，几个碱基的区别就可以分开，那样的话，正常啊，你的不同的菌，序列不一样不是正常的吗？
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王营wy
4楼2011-07-21 12:42:28
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