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王营wy

新虫 (初入文坛)

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[求助] DGGE过程中两条位置不同的条带代表同一菌种现象

各位做DGGE的前辈们，我在做DGGE时，同是嗜热链球菌但来源不同，DGGE后出现的条带在不同位置上，距离差异较大，但细菌通用引物F357GC/R518扩增同一种菌的条带位置理论上应该一致，出现这种现象的原因都有哪些呢？是存在多个克隆子？还有？

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阳光总在风雨后

1楼 2011-07-20 22:26:22

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王营wy

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送鲜花一朵

引用回帖:

Originally posted by xp198766 at 2011-07-21 12:42:28:
理认上DGGE，几个碱基的区别就可以分开，那样的话，正常啊，你的不同的菌，序列不一样不是正常的吗？

谢谢~~

阳光总在风雨后

5楼2011-07-25 08:33:17

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xiadongliang

金虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

有这种情况。有多一个菌的PCR跑完DGGE都能显示两条带。

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王营wy

2楼2011-07-21 08:55:26

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王营wy

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引用回帖:

Originally posted by xiadongliang at 2011-07-21 08:55:26:
有这种情况。有多一个菌的PCR跑完DGGE都能显示两条带。

你好，非常感谢你的回复。我现在的情况是两个菌都属于嗜热，但每个单菌只跑出一条带，而这两条带的位置不同，请问您遇到过这种情况吗？

阳光总在风雨后

3楼2011-07-21 09:39:27

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xp198766

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小木虫职业打酱油滴~~！

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理认上DGGE，几个碱基的区别就可以分开，那样的话，正常啊，你的不同的菌，序列不一样不是正常的吗？

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王营wy

4楼2011-07-21 12:42:28

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