应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
51/1返回列表
查看: 2482  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

liuhan0222

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！

通过DGGE分离到6条带，进行克隆测序，目的是要鉴定病原菌，即要知道这6条带对应的是什么菌，BLAST比对后，分别建树找出了亲缘关系最近的一种菌，但是若将6条带与其对应的序列一起建树，结果差异很大，其中几个条带单独聚在一起，与其相似序列相差很远，这是为什么啊？看了很多资料还是没弄明白，这是第一次建树，很没经验，很头疼！！！急切等待高手指点！！！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-08-15 12:45:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxb456900

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
想做16s，感觉qiime这个软件，再加些R包的可视化,非常好。在掏宝搜索“16s测序分析”，有个视频不错，从linux安装一直到查找OTU,热图，venn图，alpha分析，beta分析，构建系统树，系统树可视化。这里面完全可以解决你烦恼
赞一下 回复此楼
7楼2015-08-28 11:24:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

欣晴5832

金虫 (小有名气)
liuhan0222(金币+1): 2010-08-18 14:49:08
你这6个序列blast后，与其亲缘关系最近的序列一致度有多高？
赞一下 回复此楼
2楼2010-08-15 16:41:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuhan0222

新虫 (初入文坛)

谢谢~

你好，几乎都是100%，也有99%
麻烦你好好指导一下吧，我真的不知道该怎么办了，就因为这个结果耽误了好多事情，现在急于发文章！非常感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-18 14:53:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)
看看你的序列是不是为反向序列。
用它的反向互补序列弄一下啊
赞一下 回复此楼
4楼2010-08-18 15:50:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭