24小时热门版块排行榜    

查看: 2568  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liuhan0222

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急!!!

通过DGGE分离到6条带,进行克隆测序,目的是要鉴定病原菌,即要知道这6条带对应的是什么菌,BLAST比对后,分别建树找出了亲缘关系最近的一种菌,但是若将6条带与其对应的序列一起建树,结果差异很大,其中几个条带单独聚在一起,与其相似序列相差很远,这是为什么啊?看了很多资料还是没弄明白,这是第一次建树,很没经验,很头疼!!!急切等待高手指点!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxb456900

银虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
想做16s,感觉qiime这个软件,再加些R包的可视化,非常好。在掏宝搜索“16s测序分析”,有个视频不错,从linux安装一直到查找OTU,热图,venn图,alpha分析,beta分析,构建系统树,系统树可视化。这里面完全可以解决你烦恼
7楼2015-08-28 11:24:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

欣晴5832

金虫 (小有名气)

liuhan0222(金币+1): 2010-08-18 14:49:08
你这6个序列blast后,与其亲缘关系最近的序列一致度有多高?
2楼2010-08-15 16:41:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuhan0222

新虫 (初入文坛)

谢谢~

你好,几乎都是100%,也有99%
麻烦你好好指导一下吧,我真的不知道该怎么办了,就因为这个结果耽误了好多事情,现在急于发文章!非常感谢!
3楼2010-08-18 14:53:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)

看看你的序列是不是为反向序列。
用它的反向互补序列弄一下啊
4楼2010-08-18 15:50:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 招08考数学 +4 laoshidan 2026-03-20 8/400 2026-03-22 19:56 by 小皮蛋酱
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +4 NIFFFfff 2026-03-20 4/200 2026-03-22 09:49 by 2026paper
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[基金申请] 学校已经提交到NSFC,还能修改吗? 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿吉林大学材料学硕321求调剂 +11 Ymlll 2026-03-18 15/750 2026-03-20 19:40 by 丁丁*
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
信息提示
请填处理意见