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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于NAMD的.conf问题
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jianchaoyv

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于NAMD的.conf问题 已有2人参与

各位遇见过这种情况吗？
# Output
outputName          $outputname

restartfreq         500     ;# 500steps = every 1ps
dcdfreq             1000
xstFreq             1000
outputEnergies      100
outputPressure      100
# Minimization
minimize            300000
reinitvels          $temperature
当把minimize 设定为500时，.log文件中的能量是间隔100步输出一次；当把minimize 设定为300000时，.log文件中的能量却变成了每步都要输出一次；麻烦各位高手问题出在哪里啊？
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1楼 2010-06-25 15:14:22
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+3):谢谢 2010-06-25 16:39:35
minimize 每步都会输出一次
500 步前面就有500 次, 你可能没注意到
300000 步前面就有300000 次, 你可能没等它算完

MD run 时候才以outputEnergies 为间隔输出
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2楼2010-06-25 16:37:50
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jianchaoyv

金虫 (小有名气)
谢谢bay__gulf 的耐心指点！确实如你所说，问题已经搞明白了！
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3楼2010-06-26 08:46:19
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