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【求助】RMSD值 已有1人参与
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如何计算对接出的小分子配体和晶体中配体的RMSD值？ 对接出的结果只是单独的小分子配体结构，如果我要计算小分子和原始配体的RMSD值，是否需要将原始配体中的配体做成单独的PDB再比较？可以采用什么方法计算出来呢？尝试用SWISS-PDBviewer，VMD,PYMOL都没有计算出结果，请问各位有知道如何计算的吗？ |
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2楼2010-05-17 18:12:03