版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (5469)
>考研 (1077)
>导师招生 (974)
>文献求助 (401)
>虫友互识 (259)
>基金申请 (191)
>休闲灌水 (179)
>论文投稿 (138)
>硕博家园 (121)
>考博 (117)
>招聘信息布告栏 (96)
>博后之家 (65)
>教师之家 (64)
>绿色求助(高悬赏) (40)
>公派出国 (34)
>留学生活 (32)

返回列表

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

模拟EPI: 9
应助: 81 (初中生)
贵宾: 0.156
金币: 462.4
散金: 2274
红花: 30
帖子: 1245
在线: 1248.1小时
虫号: 591536
注册: 2008-09-02
性别: GG
专业: 环境生物物理

[交流] 【求助】RMSD值已有1人参与

如何计算对接出的小分子配体和晶体中配体的RMSD值？
对接出的结果只是单独的小分子配体结构，如果我要计算小分子和原始配体的RMSD值，是否需要将原始配体中的配体做成单独的PDB再比较？可以采用什么方法计算出来呢？尝试用SWISS-PDBviewer，VMD,PYMOL都没有计算出结果，请问各位有知道如何计算的吗？

回复此楼

» 猜你喜欢

一志愿武理材料305分求调剂已经有5人回复
材料专硕英一数二306 已经有3人回复
085600材料与化工调剂 324分已经有7人回复
311求调剂已经有3人回复
26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线已经有7人回复
295求调剂已经有5人回复
354求调剂已经有5人回复
材料专业求调剂已经有3人回复
求材料调剂已经有7人回复
一志愿天大材料与化工（085600）总分338 已经有3人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

surflex-dock对接问题已经有3人回复
周期性边界造成的RMSD异常值已经有12人回复
分子模拟小白提问各位达人指教已经有7人回复
求助如何在DS2.5中分析Standard Dynamics Cascade结果！已经有5人回复
配体与打分分子不能很好对接，怎么回事？已经有8人回复
【讨论】跑完MD后分析哪些东西啊？？？已经有15人回复
【求助】重金求助：gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件已经有8人回复
【讨论】怎样在平衡后生成最终的psf？pdb？？谢谢指点已经有14人回复
【求助】大家好，vmd能看生物分子活性吗已经有7人回复
【求助】关于离子液体体系平衡检测已经有7人回复
【在线答疑】UCSF DOCK分子对接和虚拟筛选已经有42人回复
【原创】AutoDock使用笔记总结－原创始发已经有32人回复

1楼 2010-05-17 13:08:50

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

csxyllx

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 58.8
帖子: 19
在线: 10.9小时
虫号: 833388
注册: 2009-08-24
专业: 生物信息学

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-05-17 18:12:48

写个脚本
如果不会写，就用别人写好的

赞一下(2人)