| 查看: 1100 | 回复: 14 | |||
[交流]
【讨论】怎样在平衡后生成最终的psf？pdb？？谢谢指点 已有3人参与
|
|
我自己模建的一个蛋白的三维结构，平衡动力学后，RMSD值也不错，就想生成像结晶那样含有水分子的pdb，以便后面的分析。我用这个命令生成的是含水合子的： 载入boule_wb.psf 载入boule_wb_eq.dcd 然后在Tk里输入： set all [atomselect top protein] $all writepdb final.pdb $all writepsf final.psf 怎样才能生成像结晶那样含有水分子的pdb呢？、谢谢各位指点了 |
回复此楼» 猜你喜欢
A期刊撤稿
已经有5人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有8人回复
-
26申博自荐
已经有7人回复
-
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗？
已经有4人回复
-
带资进组求博导收留
已经有9人回复
-
求助大佬们，伤口沾上了乙腈
已经有6人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求翻译一个英文句子，谢谢！
已经有7人回复
- 请教一种醛的合成方法或者建议，谢谢
已经有22人回复
- 卤代烃与羧酸钠反应生成酯的酯化反应
已经有14人回复
- 求助广大虫友： 关于用流动相稀释标品的问题 谢谢！！！
已经有9人回复
- 我想做电场的，请问一下三氯甲烷的PFO溶液是不是导电啊，谢谢
已经有6人回复
- 求过来人指点机械本科生就业的发展！！！
已经有9人回复
- 谁知道目前美国波士顿消费水平？先谢谢了！
已经有15人回复
- 羧基能与-O-CH=CH2反应生成缩醛基不
已经有3人回复
- 除掉反应生成的乙醇，拉动反应平衡。求高人指点
已经有15人回复
- 怎样用origin8对曲线进行分峰，谢谢
已经有4人回复
- 把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
已经有3人回复
- 怎么也找不到解放军理工大学学报（自然科学版）的网上投稿入口，求指点
已经有6人回复
- 【求助】如何合并文件 pdb psf
已经有4人回复
- 怎样高效的阅读文献（医学）【转载】
已经有28人回复
2楼2010-12-20 11:01:48
3楼2010-12-20 11:30:10
4楼2010-12-20 11:58:55
5楼2010-12-20 13:51:00
6楼2010-12-20 14:04:29
7楼2010-12-20 14:07:52
8楼2010-12-20 14:47:16
9楼2010-12-20 16:05:09
10楼2010-12-20 16:46:44