24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1071  |  回复: 14

nufang19a

金虫 (正式写手)


我再顶我再顶我再顶我再顶
11楼2010-12-20 17:16:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sjnyongle

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+3):鼓励交流! 2010-12-20 22:19:02
我有一个思路,不过,也比较笨,仅限参考吧!
可以通过measure minmax 来得到protein的
x,y,z方向上的最大值,protein内部的水肯定要在这个范围内,
我认为这样可以删掉很多水了,如果你的那个protein比较规整的话,
这样也许可以达到目的
12楼2010-12-20 19:35:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nufang19a

金虫 (正式写手)


这是个方法,谢谢。我怎么就没想到呢
13楼2010-12-20 19:41:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sjnyongle

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不谢啦,你如果有办法解决了,可不可以发上来,我学习一下,谢谢!
14楼2010-12-21 10:26:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+5):thank you 2010-12-21 21:20:28
set wt [atomselect top "water and within 3 of protein"]
这样可以选择距离蛋白质3A以内的水分子
set wt [atomselect top "water and sqrt((sqr(x)+sqr(y)+sqr(z))<10"]
这样可以选择以0 0 0为球心的球形内部的水分子

灵活结合这两个描述,应该能解决你的问题。

把上述描述写到Graphical representation去,可以直观的检测你的选择是否正确
15楼2010-12-21 15:54:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nufang19a 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见