【讨论】跑完MD后分析哪些东西啊？？？ - 分子模拟 - Gromacs/Amber/NAMD

2楼2011-03-29 14:46:39

superdirac

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引用回帖:

Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-03-29 14:27:27:
跑完长时间的MD后，按照研究问题的需要，要分析结果。看了文献上有分析RMSD，HB，Rg，想请教一下还可以分析哪些啊？多谢啦

这个问题问的。
你想知道什么呢？呵呵！　

我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋

3楼2011-03-29 15:02:38

匿名

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4楼2011-03-29 16:00:25

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匿名

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5楼2011-03-29 16:01:32

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superdirac

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-30 12:51:11

呵呵。
那你做模拟到底是为解决什么问题？
没有问题的话，你模拟什么啊。

我认为，酒一口一口喝，路一步一步走~步子迈大了，喀~容易扯着蛋

6楼2011-03-29 16:51:14

ghcacj

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7楼2011-03-29 16:52:38

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-30 12:50:40

其实你也看出来了，大家的意见都是看文献，其实就是这样的，就是参照人家的文献分析了哪些东西，而你自己要解决什么问题~~~这样才能说啊~

8楼2011-03-29 19:21:36

guanzhouxmc

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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-04-01 12:27:59

看文献永远是进步的源泉，文献看多了想法就多。会有“接下来做什么”想法的说明文献看的不够多。

9楼2011-03-31 14:29:04

leigp

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引用回帖:

Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-03-29 16:00:25:
对于蛋白质加溶剂这样的体系呢？可以分析哪些呢？

本人不是做蛋白质方面模拟的，个人感觉可以分析蛋白质结构，与溶剂的水合作用等。一般来说先有想法接下来才去设计采用的方案啊，你怎么正好相反啊，都确定采用分子模拟研究蛋白质了，却不知道研究什么。还是楼上说的那话，多看文献。加油

希望多向各位学习！

10楼2011-04-08 17:30:23