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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助如何在DS2.5中分析Standard Dynamics Cascade结果!

大家好,本人运行完毕DS2.5中Standard Dynamics Cascade,接下去想分析具体氨基酸残基是如何随时间和温度变换的,不知道怎么做,请指教,谢谢,下附做完Standard Dynamics Cascade后的结果图
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-24 21:52:28
leirongjian(金币+5): 谢谢回复,不过还是想继续请教下· 2011-09-25 09:02:16
DS菜单->Chart->学习绘图吧
可以选择若干行、列,来作图。
2楼2011-09-24 12:39:20
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

回复"佛前的鱼"

珍惜有阳光、健康的时光!
3楼2011-09-26 15:19:49
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

做完了standard dynamics cascade后,怎么样去分析蛋白质氨基酸残基的RMSD值随时间的变化,还有如何作图的,有经验的虫友能指导一下吗?本人在Chart项下找不到RMSD,难道是standard dynamics cascade里设置参数不对?求帮助!
珍惜有阳光、健康的时光!
4楼2011-09-26 16:14:09
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shenlin0514

木虫 (正式写手)

无名小虫

请问你的这个MD时间一共花了多长?
Never say never
5楼2011-11-25 09:54:23
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

我做的MD没有意义,我现在改用gromacs做
珍惜有阳光、健康的时光!
6楼2011-11-25 14:25:56
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