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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求助如何在DS2.5中分析Standard Dynamics Cascade结果！
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助如何在DS2.5中分析Standard Dynamics Cascade结果！

大家好，本人运行完毕DS2.5中Standard Dynamics Cascade，接下去想分析具体氨基酸残基是如何随时间和温度变换的，不知道怎么做，请指教，谢谢，下附做完Standard Dynamics Cascade后的结果图
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珍惜有阳光、健康的时光！
1楼 2011-09-24 11:23:49
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)
我做的MD没有意义，我现在改用gromacs做
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珍惜有阳光、健康的时光！
6楼2011-11-25 14:25:56
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

【答案】应助回帖

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-09-24 21:52:28
leirongjian(金币+5): 谢谢回复，不过还是想继续请教下· 2011-09-25 09:02:16
DS菜单->Chart->学习绘图吧
可以选择若干行、列，来作图。
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2楼2011-09-24 12:39:20
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)
回复"佛前的鱼"
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珍惜有阳光、健康的时光！
3楼2011-09-26 15:19:49
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leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)
做完了standard dynamics cascade后，怎么样去分析蛋白质氨基酸残基的RMSD值随时间的变化，还有如何作图的，有经验的虫友能指导一下吗？本人在Chart项下找不到RMSD，难道是standard dynamics cascade里设置参数不对？求帮助！
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珍惜有阳光、健康的时光！
4楼2011-09-26 16:14:09
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