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玉露金风

新虫 (初入文坛)

[交流] 荧光定量PCR引物问题 已有7人参与

这是某个基因引物的溶解曲线图,从图看,引物能用么?

荧光定量PCR引物问题
IMG_20160608_190839.jpg
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棍子168

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有一个专门设计星光定量引物的网站

发自小木虫Android客户端
天道酬勤
8楼2016-06-23 22:36:13
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查看全部 8 个回答

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-21 00:00:47
1) 至今不太清楚Melt Curve里Tm值和特异性的关系,但据我观察,qRT-PCR引物一般都会设计在60度以上以保证特异性,同时有些PCR程序直接以两步发进行,这些引物扩增的产物经过melt curve后基本峰值都会70左右及以上。这可能也与扩增长度有关,总之一般单峰,且峰形呈现"Sharp“特性,就可以了(除非全是引物二聚体,一般这种非特异产物的Tm在melt curve里均会在50~60左右,且峰值不够“Sharp”,比较好判别)
2) 跑一下胶,看看条带大小也能断定。
Let God do with it as He wills
2楼2016-06-20 23:43:29
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这是引物的溶解曲线吗?就我所知道的荧光定量PCR中引物的好坏是要检测产物的溶解曲线吧,这样才能衡量引物在你PCR体系里扩增的特异性。而且最好是看你所有的孔中的溶解曲线Tm值是否一致,如果有的孔好,有的孔不好,也是不能用的。
如果这是产物的溶解曲线,我一般做的正常的有变性、退火、延伸的程序(楼上说的两部发我不清楚)要求产物大小在100以上的话,似乎没有见过你这么低的Tm值,一般都是80多度。
3楼2016-06-21 09:28:59
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KEVIN_LOVE

木虫 (正式写手)

4楼2016-06-21 23:00:53
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