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cyz20050505木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助/交流】问个有关荧光定量的棘手问题,来了好几个技术支持都找不出原因。
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1.仪器:ABI7300实时定量PCR系统 2.前提条件:仪器各种的验证程序,验证板反应均为正常。在其上做绝对定量反应均为正常 3.问题来了:我首先用用普通PCR和琼脂糖电泳验证了有扩增且条带非常单一,无引物二聚体,拖尾,拖带,等一些不和谐现象,于是我就上7300,程序与参数设置也是正确的,这是发现在有ROX参比荧光的条件下,扩增曲线在进入对数增长期就断了,去掉ROX,则是正常曲线,于是我单独分析ROX,发现在扩增进入对数增长期时,ROX的信号掉到了0以下,所以导致曲线中断,但是消除ROX后,孔间重复性非常差,显然误差是极大的。于是乎我又更换了TaKaRa,TIANGEN,ABI,BioRad的荧光试剂,结果都是如此,让我悲剧了很长很长很长的时间,在不的已的情况,我去其他地方换7500做,同样的样品和试剂,就一点问题没有,ROX的信号一直很稳定,扩增曲线非常漂亮,孔间误差极小。 4.所以我怀疑:检测ROX的部件有问题?软件算法有问题?还是机器其他地方有问题,没有检测到?对于上述问题,所谓的大工程师们给不了我一个明确有用的答复,只知道做标准板,标准板是加了Taqman探针的绝对定量,是没有问题,但我们只做SYBRGreen,就是死活不行。此时此刻,又勾起了我伤心的记忆,因为我马上又不的不背起一大堆东西去别的地方做实验。 5.请大家支招,谢谢!!下次我把图片传上来,大家分析分析。 |
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