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苍蝇小田七

铜虫 (初入文坛)

[求助] 切胶回收纯化的DNA浓度太低不能用于连接载体,请教如何提高DNA浓度已有3人参与

从头说起是这样的,我是使用试剂盒提的核酸,提取后电泳没有条带。后来我用特异性引物进行了扩增,扩增结果不错,条带单一,位置大体也对,但是亮度一般。由于我的核酸不多,现在也就是还有30ul,而每次扩增模板量要2ul,所以今天上午我就把模板稀释了一下,用这个稀释的DNA又进行了扩增,准备回收纯化其中的DNA。可是PCR后电泳的结果不好,比较不亮,但是我坚持进行了切胶回收纯化,使用的是宝生物的盒子,回收后又电泳了一次,这次条带的亮度也就是能刚刚看到的样子,我自己知道这个浓度是不能做往下做连接的。求大神不吝赐教!另外还是有个问题,我发现回收后的条带位置比我PCR扩增的条带的位置更靠上了,这是怎么回事?今天没能拷出来电泳图,如果需要我后续补充。谢谢各位了!!!!
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原海亮

木虫 (著名写手)

如果使用了和聚合酶一致的条件,从你可以获得单一目的条带来看,扩增条件再优化对目的条带的浓度影响应该不大,可以适当增加循环数来提高目的条带浓度,这是最笨又最简单的方法。另外pcr模板还是不要稀释了,应该很容易得到的,你要是30微升用完了还搞不定那就肯定有问题了。最后, 我偷偷告诉楼主,日常实验中,经常回收后压根就看不到目的条带,但是照样可以进行转化而且拿到了正确克隆,所以对于你这样还可以看到目的条带的(不知道回收完是不是还要进行酶切,如果需要,建议不要回收,直接pcr产物酶切,然后再回收,避免多次回收损失),我建议可以继续进行克隆,只是连接体系适当加大,比如20微升,目的是让你可以尽量多的加入目的条带,这样挑到几个转化子还是可以的,祝好!

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
5楼2016-02-28 11:17:44
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普通回帖

kaobo2012

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-02-28 10:11:45
1.PCR后电泳的结果不好,你的PCR条件有没有优化?有些PCR酶只能耐94℃,如果用98℃变性的话,就不行了。还有退火温度什么的,都会影响PCR结果的。
2.回收后的条带位置比我PCR扩增的条带的位置更靠上。你是两个样品在同一块胶上跑的吗?
2楼2016-02-27 21:16:19
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fudan671

木虫 (著名写手)

3楼2016-02-27 21:37:18
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jackyoung

新虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-02-28 10:12:02
是提的DNA么?PCR的引物和条件有没有优化?目前这一步只能从提高PCR括增的量方面来优化。

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CestLaVie
4楼2016-02-28 00:15:16
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苍蝇小田七

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jackyoung at 2016-02-28 00:15:16
是提的DNA么?PCR的引物和条件有没有优化?目前这一步只能从提高PCR括增的量方面来优化。

谢谢你的回答!

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6楼2016-02-29 09:11:06
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苍蝇小田七

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by kaobo2012 at 2016-02-27 21:16:19
1.PCR后电泳的结果不好,你的PCR条件有没有优化?有些PCR酶只能耐94℃,如果用98℃变性的话,就不行了。还有退火温度什么的,都会影响PCR结果的。
2.回收后的条带位置比我PCR扩增的条带的位置更靠上。你是两个样品 ...

谢谢你的回答!

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7楼2016-02-29 09:11:28
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苍蝇小田七

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by fudan671 at 2016-02-27 21:37:18
应该是模版

谢谢你的回答!

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8楼2016-02-29 09:11:43
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苍蝇小田七

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 原海亮 at 2016-02-28 11:17:44
如果使用了和聚合酶一致的条件,从你可以获得单一目的条带来看,扩增条件再优化对目的条带的浓度影响应该不大,可以适当增加循环数来提高目的条带浓度,这是最笨又最简单的方法。另外pcr模板还是不要稀释了,应该很 ...

我不需要酶切的,你说的方法我也想到了,虽然核酸还可以再提,但是确实麻烦一些,我打算再用原倍的做一次,没有核酸就只能再提了。你说的可以进行克隆,我就是担心浓度太低连接不上去啊

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9楼2016-02-29 09:15:22
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qiuqu_200212

至尊木虫 (知名作家)

无助又无奈

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
多做点PCR样品,然后浓缩回收。
无奈又无助的天鹅,孤零零
10楼2016-02-29 09:30:10
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