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OLEX2解析单晶丢失碳原子

作者 深度睡眠ya
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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在用OLEX2解析单晶时,五元环上的碳上丢失了一个甲基,通过growing能够得到完整晶体,解析出来也没有A、B类错误,但是解析出来的分子放到Mercury里面显示与N相连的甲基始终有6个H,怎么修改也无法去除掉,求助是growing的步骤出错了,还是有其他的解决办法。
来个高手帮下忙OLEX2解析单晶丢失碳原子
解析后的分子.png


OLEX2解析单晶丢失碳原子-1
无A、B类错误.png

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  • 精华评论
  • Tab呱呱

    检查碳原子的占有率,应当是分子处于对称面上,这很正常,六个氢的碳应当占有率0.5

  • SAFEEEE

    不用管,画图的时候删掉一半H就行,或者在OLEX2慢慢旋转H的位置,使之不对称。

  • 深度睡眠ya

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by Tab呱呱 at 2021-04-26 09:44:05
    检查碳原子的占有率,应当是分子处于对称面上,这很正常,六个氢的碳应当占有率0.5

    在growing后得到的C原子和相邻C编号相同,且打开后还是显示不出来,但是结构式又是对的,我把文件加上了,帮我看看吧

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