病毒的进化树问题求助
您好，我最近分离到一株病毒，采用基因序列比对，并构建进化树，发现在进化树上，其处于单独的分支。但是采用该基因序列编码的氨基酸序列构建进化树，却被聚类到其他分支。就是采用基因和氨基酸序列构建的进化树不一致，怎么办？
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啊，还有这样的事情？确认倒入软件的序列没有弄错嘛
没有错
，
设置了外类群没有？进化树的拓扑结构是不是一致的？基因多序列比对有没有对齐密码子？核酸序列建树和氨基酸序列建树是不是用的同样的模型？