写信，以防万一。
有些期刊是按投稿系统的顺序，不按manuscript里的顺序，奇葩不？

按照系统次序的，校稿的时候确认一下，但你的次序不一样居然审核能通过，好奇怪

一般以pdf为准，但建议联系一下，祝好

"现在accepted manuscript上网后，自己第一作者变成第二作者了"这个是如何操作的？ Accepted manuscript 是你刚被接收的文章，作者的顺序编辑是不会改的。如果你在手稿中第一就是第一，你可以将Online 发表的文章下载下来确认一下。一般很少有出版社擅自改动作者顺序的，倒是通讯作者，有的期刊会将投稿系统的通讯也作为文章的通讯，擅自将文章的通讯也改为投稿系统的通讯，

是不是上传的word版也错了，一般以word版为主啊

Just accepted 的作者顺序是按系统的投稿作者顺序来的，不影响；proof之后就会按正式的顺序的。
投稿的时候，通讯作者没有排好顺序

没问题，online上面的不用管，pdf里面是对的就行，出版社最终按pdf的算