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PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O5 ..O5 2.29 Ang.

作者 923698418
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O5       ..O5       .       2.29 Ang.  
                                                1/2-x,y,2-z  =      3_557 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O5       ..O6       .       2.32 Ang.  
                                                1/2-x,y,2-z  =      3_557 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O6       ..O6       .       2.41 Ang.  
                                                1/2-x,y,2-z  =      3_557 Check

遇到A类错误,DFIX 2.80 0.01 O5 O5  这个命令XL之后,进行check。发现并没有解决问题....

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今日热帖
  • 精华评论
  • 卡布奇诺7

    每个警告第二行有这个对称码(1/2-x,y,2-z),表明了其中一个原子如O5是最小不对称单元中的,另外一个原子则是对称出来的,你输这个指令DFIX 2.80 0.01 O5 O5,自然是没有效果,应该加上对称操作$1_1/2-x,y,2-z,然后DFIX 2.80 0.01 O5 O5_$1,若是Olex2解析的话,可以直接找到这两个原子,选中加指令DFIX 2.80 0.01精修即可;另外还可以检查O5与O6是否需要加氢,之间是否有氢键存在。

  • 香辣糖醋肉

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 卡布奇诺7 at 2020-07-26 22:49:46
    每个警告第二行有这个对称码(1/2-x,y,2-z),表明了其中一个原子如O5是最小不对称单元中的,另外一个原子则是对称出来的,你输这个指令DFIX 2.80 0.01 O5 O5,自然是没有效果,应该加上对称操作$1_1/2-x,y,2-z,然 ...

    你好,我想请教一下PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O6 . 2.83 Ang.
                                                                                          1-x,2-y,1-z = 3_676 Check
    对称码是这个的问题怎么解决呢?然后O4和O6都与金属配位

  • 香辣糖醋肉

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by 卡布奇诺7 at 2020-07-26 22:49:46
    每个警告第二行有这个对称码(1/2-x,y,2-z),表明了其中一个原子如O5是最小不对称单元中的,另外一个原子则是对称出来的,你输这个指令DFIX 2.80 0.01 O5 O5,自然是没有效果,应该加上对称操作$1_1/2-x,y,2-z,然 ...

    您好,我想请教这几个B类错误,望解答,谢谢
    PLAT342_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.05444 Ang.
    PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D H15B ..H18B . 1.88 Ang.
                                                                    -x,2-y,1-z = 2_576 Check
    PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O17 --H17A . Please Check
    PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O17 --H17B . Please Check

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