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关于ATB生成的小分子拓扑和蛋白拓扑文件合并饿问题

作者 rppyy
来源: 小木虫 200 4 举报帖子
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请问各位老师,ATB网站生成的小分子拓扑文件,怎么和pdb2gmx生成的蛋白拓扑合并成复合物的拓扑文件(用的是gromos54a7力场),希望能详细一点(分布列举)小弟纯小白一个,祈盼各位老师不吝赐教

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  • 精华评论
  • longytu

    找个教程学习一下

  • 冷血孤峰

    拓扑里把小分子的copy到蛋白里,然后itp文件里加加上小分子的就可以

  • Yongqi琦

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by 冷血孤峰 at 2020-05-19 08:35:01
    拓扑里把小分子的copy到蛋白里,然后itp文件里加加上小分子的就可以

    请问一下,使用ATB产生了itp文件直接将其全部内容复制到txt文件中,保存为itp文件就行了,不需要做其他修改么?还是只复制其中一部分

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