最重要的不同就是因为溶剂的作用，溶剂中的分子的结构能跟气相中不太一样。既然结构不同，那得到的能量肯定会有不同。

从原理上来说，这里你说的高斯的溶剂化，指的应该是高斯自带的隐式溶剂模型。在隐式溶剂模型下，溶剂分子都被看成连续的可极化介质。溶剂对于对于溶质分子会有极化作用。这部分作用在隐式溶剂模型中被加到了Fock 算符里，成为了解波函数的一部分。被称为 SCRF。 所以解出来的最优化波函数就跟气相中不同。导致影响这个分子算出来的所有性质都会跟气相中有不同。

还有一种就是显式溶剂模型，就是真的在计算中把溶剂分子分层摆在溶质分子周围，再进行计算。这样优化出来直接就显示了溶剂分子跟溶质分子如何作用。但这样非常耗时。建模也很困难，

如果你在溶剂模型下仅仅做一个单点，而不再做结构优化，那你的前提就是：你要算的分子的结构在溶剂中和在气相中是相同的。通常，中性分子确实可以忽略掉溶剂化之后的分子结构的变化。但是如果你的分子本身带电荷，通常结构会有比较大变化。应该重新在溶剂模型下做优化才能得到准确的结构和能量。而如果你不确定你的分子在气相和溶液中是否会发生很大的结构变化，那你就还是重新在溶剂模型下优化一下才比较保险。