你看看该杂志已经发表的情况是什么样的？另外每个杂志投稿可能有不同的格式，并不是最后出版的格式，编辑可能有他自己的用意吧？也许他会后期帮你处理的。

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没见过用脚注标参考文献的，文科大概有这样的

有这样的刊物，必须按照要求改。
一般他们也给出建议的，比如加括号；如果能列文献也可以列文献。