如果你觉着内容有错误，是可以通过大修修改的，就在大修时一起修改了，如果很严重不是大修就能解决的和导师商量商量是不是应该退稿

在修改稿件的时候可以对手稿中任何部分进行修改，整体框架结构内容不变就好。建议楼主按照审稿人意见修改，并把自己觉得应该修改的地方搞准确，毕竟是科研论文，严谨性是必须的。然后在回复信件中逐一说明自己的修改，并在文中标注。相信结果会是很好的！

除了按照审稿人的意见修改之外，把你觉得错误的地方也一并修改过来。

正常情况下是只需要按照评审的意见修改即可被接收，内容上的问题你当然也是可以改的。如果是小问题就完全不用担心，放心改动；如果是很大问题（比如新的数据与原来的完全相反）影响到了整篇文章的结论，那你就需要好好考虑一下，改的话对最后的评审影响肯定很大，甚至有拒搞的可能。取决于楼主对文章的需求还是对实验严谨性的追求。
另外，如果楼主认为内容不够，完全可以放在下一篇文章，研究和发表成果都是循序渐进的，不是等你全部都研究完全了才发。而且3个评审都没说内容不够，说明他们认为目前的数据是可以支持你的结论的，楼主不必过分精益求精，

内容不要加，其他问题一并修改

错误肯定要改的，但修回信应该斟酌好语言。

我想应该是第一次修改语言、格式啥的。第二次大修你的内容。