应该写楼主所在读博的学校。该公司的作用可通过在作者中增加项目相关参与人员的名字而得到体现。

如果国内公司对你有人力，金钱等方面的支持，应该要写。而且写两个单位不会有什么冲突吧，楼主只需权衡利弊看看谁放第一，

学校吧

楼主的单位写国外学校，对方公司人员单位写国内公司。

都写吧，慎重排个次序就可以