把你引用A论文的部分连图带文字都放在supporting information里面，并注明引用。一般查重都是查的正文部分。如果还是不放心的话，可以在cover letter里面给编辑和审稿人说明清楚。

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我不太清楚你的研究领域，但是你大篇幅的引用另一篇论文的文字图表本身就不是一件好事情，就算过了编辑那一关，审稿人也可以认为你创新性不足而拒你。