楼主可以给杂志社或者主编写信说明情况，请求打开投稿系统上传supporting information；当然也可以等编辑或者审稿意见返回后再上传，

应该不要紧，如果期刊有技术审查的话，你上传的材料不全，编辑会让你把必要的材料重新上传

一样要上传supporting information 吗？

不必担心，在initial evaluation阶段发现后会让你重投的。