申请时签不签协议都没关系但是要盖外单位的章。如果项目获批了落款时再补一个合作协议留给双方单位的科技处存档就好，没有具体格式要求。申请时不需要上传合作协议。转不转款也都可以，但是要在预算里说明。预算里如果没有说明转款，那落款时就不能再转款。如果确定要转款，预算说明里要大概交代外单位具体负责什么工作，并承担多少项目金额，项目批下来时转款时要跟申请时预算里面的数额一致。预算里只说外单位承担多少钱的总数不用在具体预算里说明，但是项目下来后落款时外单位的预算跟你的预算加起来要等于你申请时预算的每一项总数对应起来。其实转不转款主要看合作方，他认可就好。因为现在大部分单位都需要有进款才认定你承担了项目，你的合作者觉得转不转款都无所谓只要带个名就好也没有关系。我是去年中的面上，就是这么处理的，希望能帮到你，

只需要盖合作单位的一级公章，之后就把该参与人当成本单位人即可。不必再写合作协议，那是私下的事情。转款是只转给协作单位，而不是合作单位

14年我有合作单位，评审专家说没有合作协议不算，我勒个去。有时候还是要看情况，有的专家就是喜欢装怪，挑刺。如果有合作单位尽量写个协议，免得评审专家挑毛病。

最好有个合作协议，也就是随便起草一份，找合作单位再盖个章