应该是只修饰后面

名词+and+名词+形容词的情况，要看整体句意才能判断形容词究竟是形容后一个还是两个都形容，像你这个句子，它的意思是：均匀的二氧化硅涂层和多孔二氧化硅层内嵌在碳纳米管的C18TMS分子上，就是说这两个东西都embedded with C18TMS molecules，也就是都内嵌在上面，所以and前后两个词都被修饰，

同意楼上。
这样的结构要根据上下文和特定的专业知识来判断。
自己写的时候要避免这样的歧义，哪怕重复一点都没有关系。