中科院生态中心 目前环境化学领域最好的
清华大学环境学院 目前环境工程最好的
北师大环境学院 目前环境科学极好的

其他的 太多 说不过来

清华大学，浙江大学，哈尔滨工业大学，北京大学，同济大学，南京大学，厦门大学 ，大连理工大学，上海交通大学，大连交通大学，中国科学技术大学，北京师范大学，南开大学 ，天津大学，中国海洋大学 ，武汉大学 ，四川大学
其实具体还要看你的实际情况，例如你以后的发展城市和自身爱好等等问题，中科院的我没列出来，其实也有很多好的所，比如北京生态中心，过程所，城市环境研究所，