脂肪酶有多种，看你要干什么，是想做生物柴油吗？试试宏基因组的方法，中国农业大学李颖教授有几个学生的论文有这部分内容。

你可以先用各种微生物适用的培养基进行筛选（比如真菌用PDA等，细菌用LB），主要是脂肪酶的检定，要确定你筛到的菌能产脂肪酶或脂肪酶产量相对较高，然后根据菌种特性做培养基优化。

初筛的时候目的是获得足够多的供试菌种，所以应该选用能够长出更多微生物的培养基，再加点可以指示哪个菌落是目的菌株的物质就行了，比如说显色圈透明圈之类的。