求助：有关微生物的分子鉴定的~~~~~~~
诸位兄弟姐妹，我现在相关微生物的分子鉴定结果已经拿到，而且已经做了blast比对，但是有的blast结果有多个相似度一样，请问这样的要怎样处理？还有的blast结果相似度很低，85%左右，这些怎么做进一步处理？如果做菌群多样性分析（生物多样性），这些数据要如何处理呢？例如：Shannon-Wiener 多样性指数，Margalef 丰富度指数，均匀度指数等。。。
[ Last edited by sl-water on 2013-2-27 at 15:53 ]
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都没有回复么。。。诸位大神帮忙啊！
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么人回答么。。。
楼主，咱俩做的一样哦，不过我也是新手
你做的分子鉴定是单个菌的16SrDNA测序比对的是吗？如果是，那看你的是什么菌，有些菌能鉴定到种，有些只能鉴定到属。
blast如果有多个不同种的结果都≥99%，那你就难以确认“种”，需要额外的实验来确认。58%这些就不用管了，差太远了。
以后做菌种鉴定都用全基因组测序通过ANI/isDDH来鉴定了。鉴定和研究一举两得。
生物多样性的话是群体的16SrDNA扩增子测序，你说的这些研究内容，测序公司应该有提供，