楼主可以考虑分段拟合
选择数据的时候，有个add all active plot in grapher的选项，点击就可以都选上，分别拟合了

感觉二阶导数确定的峰位本来就可能偏差。二阶导数是依据斜率的变换情况确定峰位的。斜率增长为正，斜率减小为负，在变化最大的地方出现极值，比如峰位所在的地方。这也决定了它对小波动比较敏感，峰位可能偏离真实峰位。但我不清楚红外谱特征，不知道会不会出现统计波动什么的

你说的“且选子峰点时，稍微变化一点，拟合后子峰位置就变化” 这里选取子峰点是什么意思，说的是不是选取峰位作为拟合用的迭代初值？方法是不是最小二乘拟合，你的光谱要拟合成什么样的曲线？如果选取同一段谱线拟合，最小二乘拟合，拟合结果是不应该因初值的微小变化而变化的。我没见过红外光谱，也不会ORIGIN，只懂一点点能谱处理。

“三个成分相同的光谱”，是要做重峰分解，对吧？如果是重叠的厉害的峰，通过拟合分解，确实会因为输入峰位微小变化结果变动很大。