双酶切效率会低点，你可以试试按顺序一个酶切后沉淀纯化后再用另一个酶切，一般1ug的DNA用5个U的酶。

先单酶切看看，看是否效率一样，确定两个酶都没有问题。如果两个酶都确定了没问题就用热敏磷酸酶做一下去磷酸化，这样起码能减少自连的情况发生几率。连接的时候做一下自连的做对照，确认是否真的是自连了。其他的暂时没想到。

你要接的目的片段是不是没有黏性末端啊
pcr是不是延伸完就拿出来了，没有经过4度20分钟啊？
这样的话就不好接

这2种酶是不是可以用同一缓冲液的
可以的话，一般双酶切的酶用量在5-10倍，酶切会比较完全

我记得XhoI和EcoRI，如果使用NEB的酶的话，双酶切要用EcoRI对应的Buffer. 不过对于第一次做酶切质粒，单酶切也要一起做。
如果单酶切没问题，双酶切也应该问题不大，虽然距离比较近，效率低一些。
如果再不行，那就改为分步酶切，先做难切的那个，但是Buffer要用两者都适用的那种；
如果还不行，那就先连接到克隆载体上，比如pGEM之类的，因为用Taq酶PCR的时候会在两个末端加上A，而克隆载体一般都是线性的载体，两端都有T，所以按照试剂盒的操作很快就能完成，这样在酶切的肯定是没问题的，就是花点时间而已（我开始的时候也遇到酶切不行，自连的情况，不过我个人不建议用碱性磷酸酶来避免自连，觉得会降低效率，所以后来就用克隆载体先连接，在酶切，这样就好了）。
如果还是不行，那你只能用绝招了——LIC（Ligation independent cloning)，具体你可以参考文献，现在这个方法已经用的很成熟了，我们实验室还发明了chemical ligation的方法，只要10min就可以把基因片段和载体连上，而且连接效率95%，自连几乎为零，我已经用这个方法构建基因库了，不过要等paper发了再和大家分享吧。

这些是我的经验，希望对你有用，