GV是gauusian配套使用的,可以很好的调整对称性，运算的时候可以直接submit

chem3d上面有和Gaussian的链接，可以直接从
Chem3D打开Gaussian运算，本身也带有分子力场计算功能，还可以和Mopac 链接
   可以打开的文件主要有以下几种：
   *.gjf,*.fch,*.cub,这几种是Gaussian的输入、formcheck和cube文件
   *.dat,*.mop,*.mpc,mopac的输入文件
   *.zmt,这个是内坐标格式的分子构型文件，和HyperChem、mopac通用
   *.pdb,*.ent,Protein DB格式，和HyperChem、AlChem等等通用，Gaussian
   本身也可以用这两种格式来生成内坐标文件
   *.mol,MDL的mol格式，和HyperChem稍微有点不兼容，但是如果用AlChem打开
   在保存一下（仍然是*.mol），Chem3D和HyperChem都可以打开了

   最有用的可能是*.zmt,*.mol,*.gjf,*.fch四种格式
   比如用Gaussian优化以后，在Ultilities选项里面选formcheck，就可以吧
   check文件*.chk转化成*.fch，而*.fch是可以直接用Chem3D打开的
   *.zmt是一内坐标的分子结构文件，我这里有个小软件可以把这种格式的文件
   转换成*.gjf，是Gaussian的分子内坐标文件，但没有route section等等

   Chem3D除了生成Gaussian输入文件以外，还有许多不错的功能
   比如可以手动地转动某一个键，可以用鼠标显示某个键长，键角和二面角等
   地大小，等等，还可以显示所以内坐标
   显示也有各种模型方式，比如球棍、stick等等，可以显示原子编号原子名称
   但是没有GaussView和HyperChem以及AlChem，WinMopac等等漂亮

[ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:44 ]，

其实你选择哪一个都可以满足你的使用

[ Last edited by javacfish on 2009-12-10 at 20:43 ]

谢谢javacfish！
讲解得很到位，辛苦了！

其实一开始可以还是尝试一下自己手动输入(分子坐标的信息用软件生成好了)，这样才能明白哪里要多一个空格，要少空格等，这样的印象会更深，以后碰到问题时也能知道怎么解决，不要过度依赖软件。