calst可以吧，昨晚听宿舍哥们讲得，我不是做计算的，

汗，这还不简单啊，用chemicaldraw画出分子式，然后放chem3D里面用MM2优化一下下，保存为高斯view文件看有否不正常情况，真长再保存为高斯文件，然后坐标不就有了么 ，

也可以在hyperchem里画

直接可以用gaussianview构造出来。着手学一学吧，挺简单。
然后用gaussian优化一下，找到稳定结构。
可以看看高斯手册，或者那本著名的电子结构，网上就有。

先在gaussview里画出分子结构，然后优化，找到稳定结构，就可得到你想要的坐标。

Chemdraw->Chem3D->Gview;也可以直接用GView.