一般情况下，使用的裸管，就直接使用正极性，就是阳极在进样端，因为EOF是从阳极到阴极。
如果管壁进行了修饰而带上了正电荷，或者溶液中含有较高的浓度的带正电的表面活性剂或聚合物，如CTAB，DDAB，PDDA，PEI，离子液体等等，此时EOF方向是从阴极到阳极，所以你需要使用负极性高压，也就是将阴极置于进样端。

在缓冲中添加高浓度的3-吲哚乙酸是有可能引起eof反向的。在pH13的条件下，3-吲哚乙酸的吲哚基五元环上的季胺完全电离而使五元环带上正电荷，从而吸附在带负电的管壁使eof反向。具体的情况类似于咪唑离子液体使eof反向的情况。
但是具体情况还需要具体分析，你需要把具体的缓冲组成说出来

从你的缓冲组成来看，应该pH不会是12.8，应该是吲哚乙酸钠吧

是的，用氢氧化钠调pH至12.8，

lz要检测的东西是负离子还是正离子啊？倘若检测的是负离子，在高pH条件下，电渗流比较大，可能比离子淌度高一个数量级，用正向电压，若在较低pH条件下，电渗流接近于零的，肯定要用反压，不然检测的物质就不出峰了。正离子就相反。
不过电渗的增大和减小和管径也有一定关系，有文献上说75um的管里的电渗，随着pH的提高，先增大后减小了。
阳离子表面活性剂加进去可以改变电渗方向，不过是有个临界浓度的吧，加的太少效果就不一定了。

[ Last edited by cpn on 2009-4-29 at 23:40 ]，

呵呵，我最近也在做糖的毛细管电泳分析，不过用的直接紫外检测，通过把糖衍生的方法使之带上具紫外吸收的基团。不过有些手性异构体分不开了，正在头疼中。。。