前面有个帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=816450
去看看吧

仅做参考吧：
在xp 中，应用 cent 命令，分别选中l两个芳香环，然后，join  bang 命令，可以测出两换之间的距离，再找两个环所在平面之间的家教， 也可以在dimond 里面，直接点工具栏中的measure : didronal  angle来侧俩.

在mercury中，给两个芳环分别加平面，然后点角度测量，在分别点两个平面即可得到两平面的夹角。

测距离也是一样的。可以测点到平面的距离，也可以测两芳香环中心的距离：分别选住两芳香环，给中心加一个原子，然后测两个中心的加的原子距离即可，